Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZQ0

Ccdc189, Coiled-coil domain-containing protein 189, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc189Q6NZQ0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc189Q6NZQ0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc189Q6NZQ0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc189Q6NZQ0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc189Q6NZQ0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc189Q6NZQ0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc189Q6NZQ0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc189Q6NZQ0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc189Q6NZQ0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc189Q6NZQ0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc189Q6NZQ0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc189Q6NZQ0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc189Q6NZQ0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc189Q6NZQ0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc189Q6NZQ0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc189Q6NZQ0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc189Q6NZQ0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc189Q6NZQ0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc189Q6NZQ0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc189Q6NZQ0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc189Q6NZQ0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc189Q6NZQ0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc189Q6NZQ0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc189Q6NZQ0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc189Q6NZQ0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc189Q6NZQ0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc189Q6NZQ0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc189Q6NZQ0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc189Q6NZQ0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc189Q6NZQ0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc189Q6NZQ0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc189Q6NZQ0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc189Q6NZQ0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc189Q6NZQ0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc189Q6NZQ0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc189Q6NZQ0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc189Q6NZQ0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc189Q6NZQ0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc189Q6NZQ0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc189Q6NZQ0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc189Q6NZQ0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc189Q6NZQ0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc189Q6NZQ0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc189Q6NZQ0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc189Q6NZQ0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc189Q6NZQ0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc189Q6NZQ0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc189Q6NZQ0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc189Q6NZQ0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc189Q6NZQ0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc189Q6NZQ0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc189Q6NZQ0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc189Q6NZQ0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc189Q6NZQ0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc189Q6NZQ0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc189Q6NZQ0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc189Q6NZQ0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc189Q6NZQ0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc189Q6NZQ0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc189Q6NZQ0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc189Q6NZQ0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc189Q6NZQ0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc189Q6NZQ0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc189Q6NZQ0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc189Q6NZQ0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc189Q6NZQ0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc189Q6NZQ0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc189Q6NZQ0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc189Q6NZQ0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc189Q6NZQ0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc189Q6NZQ0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc189Q6NZQ0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc189Q6NZQ0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc189Q6NZQ0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc189Q6NZQ0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc189Q6NZQ0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc189Q6NZQ0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc189Q6NZQ0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc189Q6NZQ0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc189Q6NZQ0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc189Q6NZQ0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc189Q6NZQ0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc189Q6NZQ0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc189Q6NZQ0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc189Q6NZQ0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc189Q6NZQ0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc189Q6NZQ0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc189Q6NZQ0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc189Q6NZQ0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc189Q6NZQ0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc189Q6NZQ0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc189Q6NZQ0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc189Q6NZQ0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc189Q6NZQ0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc189Q6NZQ0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc189Q6NZQ0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc189Q6NZQ0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc189Q6NZQ0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc189Q6NZQ0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc189Q6NZQ0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms