Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gpbp1Q6NXH3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gpbp1Q6NXH3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gpbp1Q6NXH3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gpbp1Q6NXH3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gpbp1Q6NXH3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gpbp1Q6NXH3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gpbp1Q6NXH3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gpbp1Q6NXH3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Gpbp1Q6NXH3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gpbp1Q6NXH3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gpbp1Q6NXH3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gpbp1Q6NXH3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gpbp1Q6NXH3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gpbp1Q6NXH3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gpbp1Q6NXH3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gpbp1Q6NXH3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gpbp1Q6NXH3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gpbp1Q6NXH3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gpbp1Q6NXH3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gpbp1Q6NXH3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gpbp1Q6NXH3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Gpbp1Q6NXH3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gpbp1Q6NXH3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gpbp1Q6NXH3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gpbp1Q6NXH3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gpbp1Q6NXH3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gpbp1Q6NXH3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gpbp1Q6NXH3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gpbp1Q6NXH3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gpbp1Q6NXH3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gpbp1Q6NXH3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gpbp1Q6NXH3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Gpbp1Q6NXH3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gpbp1Q6NXH3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gpbp1Q6NXH3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gpbp1Q6NXH3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gpbp1Q6NXH3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gpbp1Q6NXH3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gpbp1Q6NXH3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gpbp1Q6NXH3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gpbp1Q6NXH3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gpbp1Q6NXH3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gpbp1Q6NXH3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gpbp1Q6NXH3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gpbp1Q6NXH3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gpbp1Q6NXH3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gpbp1Q6NXH3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gpbp1Q6NXH3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gpbp1Q6NXH3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gpbp1Q6NXH3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Gpbp1Q6NXH3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gpbp1Q6NXH3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gpbp1Q6NXH3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gpbp1Q6NXH3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gpbp1Q6NXH3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gpbp1Q6NXH3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gpbp1Q6NXH3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gpbp1Q6NXH3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gpbp1Q6NXH3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gpbp1Q6NXH3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gpbp1Q6NXH3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Gpbp1Q6NXH3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gpbp1Q6NXH3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gpbp1Q6NXH3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gpbp1Q6NXH3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gpbp1Q6NXH3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gpbp1Q6NXH3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gpbp1Q6NXH3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gpbp1Q6NXH3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gpbp1Q6NXH3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gpbp1Q6NXH3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gpbp1Q6NXH3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gpbp1Q6NXH3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gpbp1Q6NXH3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gpbp1Q6NXH3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gpbp1Q6NXH3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gpbp1Q6NXH3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gpbp1Q6NXH3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gpbp1Q6NXH3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gpbp1Q6NXH3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gpbp1Q6NXH3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gpbp1Q6NXH3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gpbp1Q6NXH3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gpbp1Q6NXH3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gpbp1Q6NXH3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gpbp1Q6NXH3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gpbp1Q6NXH3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gpbp1Q6NXH3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gpbp1Q6NXH3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gpbp1Q6NXH3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gpbp1Q6NXH3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gpbp1Q6NXH3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gpbp1Q6NXH3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gpbp1Q6NXH3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gpbp1Q6NXH3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Gpbp1Q6NXH3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Gpbp1Q6NXH3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gpbp1Q6NXH3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gpbp1Q6NXH3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms