Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWW9

Fndc3b, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3bQ6NWW9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Fndc3bQ6NWW9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fndc3bQ6NWW9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Fndc3bQ6NWW9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Fndc3bQ6NWW9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fndc3bQ6NWW9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fndc3bQ6NWW9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fndc3bQ6NWW9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fndc3bQ6NWW9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fndc3bQ6NWW9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fndc3bQ6NWW9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fndc3bQ6NWW9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fndc3bQ6NWW9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fndc3bQ6NWW9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fndc3bQ6NWW9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fndc3bQ6NWW9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Fndc3bQ6NWW9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fndc3bQ6NWW9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fndc3bQ6NWW9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fndc3bQ6NWW9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fndc3bQ6NWW9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fndc3bQ6NWW9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fndc3bQ6NWW9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fndc3bQ6NWW9 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Fndc3bQ6NWW9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fndc3bQ6NWW9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fndc3bQ6NWW9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fndc3bQ6NWW9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fndc3bQ6NWW9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fndc3bQ6NWW9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fndc3bQ6NWW9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fndc3bQ6NWW9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fndc3bQ6NWW9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fndc3bQ6NWW9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fndc3bQ6NWW9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fndc3bQ6NWW9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fndc3bQ6NWW9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Fndc3bQ6NWW9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fndc3bQ6NWW9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Fndc3bQ6NWW9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fndc3bQ6NWW9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fndc3bQ6NWW9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fndc3bQ6NWW9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fndc3bQ6NWW9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fndc3bQ6NWW9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fndc3bQ6NWW9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fndc3bQ6NWW9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fndc3bQ6NWW9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fndc3bQ6NWW9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fndc3bQ6NWW9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Fndc3bQ6NWW9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fndc3bQ6NWW9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fndc3bQ6NWW9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Fndc3bQ6NWW9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fndc3bQ6NWW9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fndc3bQ6NWW9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Fndc3bQ6NWW9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fndc3bQ6NWW9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fndc3bQ6NWW9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fndc3bQ6NWW9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fndc3bQ6NWW9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fndc3bQ6NWW9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fndc3bQ6NWW9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fndc3bQ6NWW9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fndc3bQ6NWW9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fndc3bQ6NWW9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fndc3bQ6NWW9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fndc3bQ6NWW9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fndc3bQ6NWW9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fndc3bQ6NWW9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Fndc3bQ6NWW9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fndc3bQ6NWW9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fndc3bQ6NWW9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fndc3bQ6NWW9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fndc3bQ6NWW9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fndc3bQ6NWW9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fndc3bQ6NWW9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fndc3bQ6NWW9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fndc3bQ6NWW9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fndc3bQ6NWW9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fndc3bQ6NWW9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fndc3bQ6NWW9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Fndc3bQ6NWW9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fndc3bQ6NWW9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Fndc3bQ6NWW9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fndc3bQ6NWW9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fndc3bQ6NWW9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fndc3bQ6NWW9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fndc3bQ6NWW9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Fndc3bQ6NWW9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fndc3bQ6NWW9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fndc3bQ6NWW9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fndc3bQ6NWW9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Fndc3bQ6NWW9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Fndc3bQ6NWW9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fndc3bQ6NWW9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fndc3bQ6NWW9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Fndc3bQ6NWW9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Fndc3bQ6NWW9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fndc3bQ6NWW9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms