Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Pdcd11Q6NS46 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Pdcd11Q6NS46 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Pdcd11Q6NS46 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Pdcd11Q6NS46 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Pdcd11Q6NS46 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Pdcd11Q6NS46 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Pdcd11Q6NS46 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Pdcd11Q6NS46 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Pdcd11Q6NS46 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Pdcd11Q6NS46 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Pdcd11Q6NS46 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Pdcd11Q6NS46 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Pdcd11Q6NS46 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Pdcd11Q6NS46 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Pdcd11Q6NS46 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Pdcd11Q6NS46 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Pdcd11Q6NS46 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pdcd11Q6NS46 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pdcd11Q6NS46 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pdcd11Q6NS46 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pdcd11Q6NS46 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pdcd11Q6NS46 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pdcd11Q6NS46 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pdcd11Q6NS46 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pdcd11Q6NS46 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pdcd11Q6NS46 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pdcd11Q6NS46 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pdcd11Q6NS46 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pdcd11Q6NS46 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pdcd11Q6NS46 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pdcd11Q6NS46 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pdcd11Q6NS46 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pdcd11Q6NS46 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pdcd11Q6NS46 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Pdcd11Q6NS46 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Pdcd11Q6NS46 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Pdcd11Q6NS46 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Pdcd11Q6NS46 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Pdcd11Q6NS46 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Pdcd11Q6NS46 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Pdcd11Q6NS46 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Pdcd11Q6NS46 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pdcd11Q6NS46 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pdcd11Q6NS46 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Pdcd11Q6NS46 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pdcd11Q6NS46 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Pdcd11Q6NS46 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pdcd11Q6NS46 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pdcd11Q6NS46 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pdcd11Q6NS46 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pdcd11Q6NS46 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pdcd11Q6NS46 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pdcd11Q6NS46 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pdcd11Q6NS46 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pdcd11Q6NS46 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pdcd11Q6NS46 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pdcd11Q6NS46 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Pdcd11Q6NS46 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Pdcd11Q6NS46 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Pdcd11Q6NS46 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Pdcd11Q6NS46 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Pdcd11Q6NS46 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Pdcd11Q6NS46 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pdcd11Q6NS46 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pdcd11Q6NS46 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pdcd11Q6NS46 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pdcd11Q6NS46 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pdcd11Q6NS46 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pdcd11Q6NS46 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pdcd11Q6NS46 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pdcd11Q6NS46 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Pdcd11Q6NS46 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pdcd11Q6NS46 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Pdcd11Q6NS46 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Pdcd11Q6NS46 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pdcd11Q6NS46 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pdcd11Q6NS46 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pdcd11Q6NS46 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pdcd11Q6NS46 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Pdcd11Q6NS46 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Pdcd11Q6NS46 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Pdcd11Q6NS46 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Pdcd11Q6NS46 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Pdcd11Q6NS46 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Pdcd11Q6NS46 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pdcd11Q6NS46 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pdcd11Q6NS46 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pdcd11Q6NS46 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pdcd11Q6NS46 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pdcd11Q6NS46 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pdcd11Q6NS46 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pdcd11Q6NS46 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pdcd11Q6NS46 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pdcd11Q6NS46 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pdcd11Q6NS46 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pdcd11Q6NS46 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pdcd11Q6NS46 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pdcd11Q6NS46 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pdcd11Q6NS46 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms