Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atg16l2Q6KAU8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atg16l2Q6KAU8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atg16l2Q6KAU8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atg16l2Q6KAU8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atg16l2Q6KAU8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atg16l2Q6KAU8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atg16l2Q6KAU8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atg16l2Q6KAU8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Atg16l2Q6KAU8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atg16l2Q6KAU8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atg16l2Q6KAU8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atg16l2Q6KAU8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atg16l2Q6KAU8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Atg16l2Q6KAU8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atg16l2Q6KAU8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atg16l2Q6KAU8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atg16l2Q6KAU8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atg16l2Q6KAU8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atg16l2Q6KAU8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atg16l2Q6KAU8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atg16l2Q6KAU8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atg16l2Q6KAU8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atg16l2Q6KAU8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atg16l2Q6KAU8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atg16l2Q6KAU8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atg16l2Q6KAU8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Atg16l2Q6KAU8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atg16l2Q6KAU8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atg16l2Q6KAU8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atg16l2Q6KAU8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atg16l2Q6KAU8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Atg16l2Q6KAU8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atg16l2Q6KAU8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atg16l2Q6KAU8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atg16l2Q6KAU8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg16l2Q6KAU8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg16l2Q6KAU8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg16l2Q6KAU8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg16l2Q6KAU8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg16l2Q6KAU8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg16l2Q6KAU8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg16l2Q6KAU8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg16l2Q6KAU8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg16l2Q6KAU8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg16l2Q6KAU8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atg16l2Q6KAU8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atg16l2Q6KAU8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atg16l2Q6KAU8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atg16l2Q6KAU8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atg16l2Q6KAU8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atg16l2Q6KAU8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atg16l2Q6KAU8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atg16l2Q6KAU8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atg16l2Q6KAU8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atg16l2Q6KAU8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atg16l2Q6KAU8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atg16l2Q6KAU8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atg16l2Q6KAU8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atg16l2Q6KAU8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atg16l2Q6KAU8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atg16l2Q6KAU8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atg16l2Q6KAU8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atg16l2Q6KAU8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atg16l2Q6KAU8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atg16l2Q6KAU8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atg16l2Q6KAU8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atg16l2Q6KAU8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atg16l2Q6KAU8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atg16l2Q6KAU8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atg16l2Q6KAU8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Atg16l2Q6KAU8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atg16l2Q6KAU8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atg16l2Q6KAU8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atg16l2Q6KAU8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atg16l2Q6KAU8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atg16l2Q6KAU8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atg16l2Q6KAU8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atg16l2Q6KAU8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg16l2Q6KAU8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg16l2Q6KAU8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg16l2Q6KAU8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg16l2Q6KAU8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg16l2Q6KAU8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg16l2Q6KAU8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg16l2Q6KAU8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg16l2Q6KAU8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg16l2Q6KAU8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg16l2Q6KAU8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg16l2Q6KAU8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg16l2Q6KAU8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg16l2Q6KAU8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg16l2Q6KAU8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg16l2Q6KAU8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg16l2Q6KAU8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg16l2Q6KAU8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atg16l2Q6KAU8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atg16l2Q6KAU8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atg16l2Q6KAU8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atg16l2Q6KAU8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms