Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt40Q6IFX3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt40Q6IFX3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt40Q6IFX3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt40Q6IFX3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt40Q6IFX3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt40Q6IFX3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt40Q6IFX3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt40Q6IFX3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt40Q6IFX3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt40Q6IFX3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt40Q6IFX3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt40Q6IFX3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt40Q6IFX3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt40Q6IFX3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt40Q6IFX3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt40Q6IFX3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt40Q6IFX3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt40Q6IFX3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt40Q6IFX3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt40Q6IFX3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt40Q6IFX3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt40Q6IFX3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt40Q6IFX3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt40Q6IFX3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt40Q6IFX3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt40Q6IFX3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt40Q6IFX3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt40Q6IFX3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Krt40Q6IFX3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Krt40Q6IFX3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt40Q6IFX3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt40Q6IFX3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt40Q6IFX3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt40Q6IFX3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt40Q6IFX3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt40Q6IFX3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt40Q6IFX3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt40Q6IFX3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt40Q6IFX3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt40Q6IFX3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt40Q6IFX3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt40Q6IFX3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt40Q6IFX3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt40Q6IFX3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt40Q6IFX3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt40Q6IFX3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt40Q6IFX3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt40Q6IFX3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt40Q6IFX3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt40Q6IFX3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt40Q6IFX3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt40Q6IFX3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt40Q6IFX3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt40Q6IFX3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt40Q6IFX3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt40Q6IFX3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt40Q6IFX3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt40Q6IFX3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt40Q6IFX3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt40Q6IFX3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt40Q6IFX3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt40Q6IFX3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt40Q6IFX3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt40Q6IFX3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt40Q6IFX3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt40Q6IFX3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt40Q6IFX3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt40Q6IFX3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt40Q6IFX3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt40Q6IFX3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt40Q6IFX3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt40Q6IFX3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt40Q6IFX3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt40Q6IFX3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt40Q6IFX3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Krt40Q6IFX3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Krt40Q6IFX3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Krt40Q6IFX3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Krt40Q6IFX3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Krt40Q6IFX3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Krt40Q6IFX3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Krt40Q6IFX3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Krt40Q6IFX3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Krt40Q6IFX3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt40Q6IFX3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt40Q6IFX3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt40Q6IFX3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt40Q6IFX3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt40Q6IFX3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt40Q6IFX3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt40Q6IFX3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt40Q6IFX3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt40Q6IFX3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt40Q6IFX3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt40Q6IFX3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt40Q6IFX3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt40Q6IFX3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt40Q6IFX3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt40Q6IFX3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms