Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Arhgap20Q6IFT4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Arhgap20Q6IFT4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Arhgap20Q6IFT4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Arhgap20Q6IFT4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Arhgap20Q6IFT4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Arhgap20Q6IFT4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Arhgap20Q6IFT4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Arhgap20Q6IFT4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Arhgap20Q6IFT4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Arhgap20Q6IFT4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Arhgap20Q6IFT4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Arhgap20Q6IFT4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Arhgap20Q6IFT4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Arhgap20Q6IFT4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Arhgap20Q6IFT4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Arhgap20Q6IFT4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Arhgap20Q6IFT4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Arhgap20Q6IFT4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Arhgap20Q6IFT4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Arhgap20Q6IFT4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Arhgap20Q6IFT4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Arhgap20Q6IFT4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Arhgap20Q6IFT4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Arhgap20Q6IFT4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Arhgap20Q6IFT4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Arhgap20Q6IFT4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Arhgap20Q6IFT4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Arhgap20Q6IFT4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Arhgap20Q6IFT4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Arhgap20Q6IFT4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Arhgap20Q6IFT4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Arhgap20Q6IFT4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Arhgap20Q6IFT4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Arhgap20Q6IFT4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Arhgap20Q6IFT4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Arhgap20Q6IFT4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Arhgap20Q6IFT4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Arhgap20Q6IFT4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Arhgap20Q6IFT4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Arhgap20Q6IFT4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Arhgap20Q6IFT4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Arhgap20Q6IFT4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Arhgap20Q6IFT4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Arhgap20Q6IFT4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Arhgap20Q6IFT4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Arhgap20Q6IFT4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Arhgap20Q6IFT4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Arhgap20Q6IFT4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Arhgap20Q6IFT4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Arhgap20Q6IFT4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Arhgap20Q6IFT4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Arhgap20Q6IFT4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Arhgap20Q6IFT4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Arhgap20Q6IFT4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Arhgap20Q6IFT4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Arhgap20Q6IFT4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Arhgap20Q6IFT4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Arhgap20Q6IFT4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Arhgap20Q6IFT4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Arhgap20Q6IFT4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Arhgap20Q6IFT4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Arhgap20Q6IFT4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Arhgap20Q6IFT4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Arhgap20Q6IFT4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Arhgap20Q6IFT4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Arhgap20Q6IFT4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Arhgap20Q6IFT4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Arhgap20Q6IFT4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Arhgap20Q6IFT4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Arhgap20Q6IFT4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Arhgap20Q6IFT4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Arhgap20Q6IFT4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Arhgap20Q6IFT4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Arhgap20Q6IFT4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Arhgap20Q6IFT4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Arhgap20Q6IFT4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Arhgap20Q6IFT4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Arhgap20Q6IFT4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Arhgap20Q6IFT4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Arhgap20Q6IFT4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Arhgap20Q6IFT4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Arhgap20Q6IFT4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Arhgap20Q6IFT4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Arhgap20Q6IFT4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Arhgap20Q6IFT4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Arhgap20Q6IFT4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Arhgap20Q6IFT4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Arhgap20Q6IFT4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Arhgap20Q6IFT4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Arhgap20Q6IFT4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Arhgap20Q6IFT4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Arhgap20Q6IFT4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Arhgap20Q6IFT4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Arhgap20Q6IFT4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Arhgap20Q6IFT4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Arhgap20Q6IFT4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Arhgap20Q6IFT4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Arhgap20Q6IFT4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Arhgap20Q6IFT4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms