Protein–RNA interactions for Protein: Q6IE21

Otud6a, OTU domain-containing protein 6A, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6aQ6IE21 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otud6aQ6IE21 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud6aQ6IE21 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud6aQ6IE21 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud6aQ6IE21 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud6aQ6IE21 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud6aQ6IE21 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud6aQ6IE21 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud6aQ6IE21 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud6aQ6IE21 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud6aQ6IE21 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud6aQ6IE21 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud6aQ6IE21 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud6aQ6IE21 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud6aQ6IE21 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud6aQ6IE21 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Otud6aQ6IE21 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Otud6aQ6IE21 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otud6aQ6IE21 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otud6aQ6IE21 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otud6aQ6IE21 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otud6aQ6IE21 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otud6aQ6IE21 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Otud6aQ6IE21 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otud6aQ6IE21 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otud6aQ6IE21 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otud6aQ6IE21 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otud6aQ6IE21 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otud6aQ6IE21 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otud6aQ6IE21 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otud6aQ6IE21 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otud6aQ6IE21 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otud6aQ6IE21 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud6aQ6IE21 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud6aQ6IE21 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud6aQ6IE21 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud6aQ6IE21 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud6aQ6IE21 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud6aQ6IE21 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud6aQ6IE21 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud6aQ6IE21 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud6aQ6IE21 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud6aQ6IE21 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud6aQ6IE21 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud6aQ6IE21 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud6aQ6IE21 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud6aQ6IE21 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud6aQ6IE21 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud6aQ6IE21 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud6aQ6IE21 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud6aQ6IE21 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud6aQ6IE21 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud6aQ6IE21 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud6aQ6IE21 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud6aQ6IE21 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud6aQ6IE21 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud6aQ6IE21 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud6aQ6IE21 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud6aQ6IE21 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Otud6aQ6IE21 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Otud6aQ6IE21 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Otud6aQ6IE21 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Otud6aQ6IE21 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otud6aQ6IE21 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otud6aQ6IE21 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otud6aQ6IE21 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otud6aQ6IE21 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otud6aQ6IE21 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otud6aQ6IE21 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otud6aQ6IE21 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otud6aQ6IE21 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otud6aQ6IE21 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otud6aQ6IE21 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud6aQ6IE21 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud6aQ6IE21 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud6aQ6IE21 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud6aQ6IE21 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud6aQ6IE21 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud6aQ6IE21 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud6aQ6IE21 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud6aQ6IE21 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud6aQ6IE21 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud6aQ6IE21 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud6aQ6IE21 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud6aQ6IE21 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otud6aQ6IE21 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otud6aQ6IE21 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otud6aQ6IE21 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otud6aQ6IE21 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otud6aQ6IE21 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otud6aQ6IE21 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otud6aQ6IE21 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otud6aQ6IE21 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otud6aQ6IE21 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otud6aQ6IE21 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otud6aQ6IE21 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otud6aQ6IE21 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otud6aQ6IE21 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otud6aQ6IE21 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Otud6aQ6IE21 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms