Protein–RNA interactions for Protein: Q6EDY6

Carmil1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil1Q6EDY6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Carmil1Q6EDY6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Carmil1Q6EDY6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
Carmil1Q6EDY6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Carmil1Q6EDY6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Carmil1Q6EDY6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Carmil1Q6EDY6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Carmil1Q6EDY6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Carmil1Q6EDY6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Carmil1Q6EDY6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Carmil1Q6EDY6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Carmil1Q6EDY6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
Carmil1Q6EDY6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
Carmil1Q6EDY6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Carmil1Q6EDY6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Carmil1Q6EDY6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Carmil1Q6EDY6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Carmil1Q6EDY6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Carmil1Q6EDY6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Carmil1Q6EDY6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Carmil1Q6EDY6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Carmil1Q6EDY6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Carmil1Q6EDY6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Carmil1Q6EDY6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Carmil1Q6EDY6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Carmil1Q6EDY6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Carmil1Q6EDY6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
Carmil1Q6EDY6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
Carmil1Q6EDY6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Carmil1Q6EDY6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Carmil1Q6EDY6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Carmil1Q6EDY6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Carmil1Q6EDY6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Carmil1Q6EDY6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Carmil1Q6EDY6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Carmil1Q6EDY6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Carmil1Q6EDY6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Carmil1Q6EDY6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Carmil1Q6EDY6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Carmil1Q6EDY6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Carmil1Q6EDY6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
Carmil1Q6EDY6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
Carmil1Q6EDY6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Carmil1Q6EDY6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Carmil1Q6EDY6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Carmil1Q6EDY6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Carmil1Q6EDY6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Carmil1Q6EDY6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Carmil1Q6EDY6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Carmil1Q6EDY6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Carmil1Q6EDY6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Carmil1Q6EDY6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Carmil1Q6EDY6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Carmil1Q6EDY6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
Carmil1Q6EDY6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
Carmil1Q6EDY6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Carmil1Q6EDY6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Carmil1Q6EDY6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Carmil1Q6EDY6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Carmil1Q6EDY6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Carmil1Q6EDY6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
Carmil1Q6EDY6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Carmil1Q6EDY6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Carmil1Q6EDY6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Carmil1Q6EDY6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Carmil1Q6EDY6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Carmil1Q6EDY6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Carmil1Q6EDY6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Carmil1Q6EDY6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
Carmil1Q6EDY6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Carmil1Q6EDY6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Carmil1Q6EDY6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Carmil1Q6EDY6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Carmil1Q6EDY6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Carmil1Q6EDY6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Carmil1Q6EDY6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Carmil1Q6EDY6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Carmil1Q6EDY6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Carmil1Q6EDY6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Carmil1Q6EDY6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Carmil1Q6EDY6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Carmil1Q6EDY6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Carmil1Q6EDY6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
Carmil1Q6EDY6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Carmil1Q6EDY6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Carmil1Q6EDY6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Carmil1Q6EDY6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Carmil1Q6EDY6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Carmil1Q6EDY6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Carmil1Q6EDY6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Carmil1Q6EDY6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Carmil1Q6EDY6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Carmil1Q6EDY6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
Carmil1Q6EDY6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Carmil1Q6EDY6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Carmil1Q6EDY6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Carmil1Q6EDY6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Carmil1Q6EDY6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Carmil1Q6EDY6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Carmil1Q6EDY6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms