Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZP3

Pnkd, Probable hydrolase PNKD, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnkdQ69ZP3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PnkdQ69ZP3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PnkdQ69ZP3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PnkdQ69ZP3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PnkdQ69ZP3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PnkdQ69ZP3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PnkdQ69ZP3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PnkdQ69ZP3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PnkdQ69ZP3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PnkdQ69ZP3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PnkdQ69ZP3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PnkdQ69ZP3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PnkdQ69ZP3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PnkdQ69ZP3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PnkdQ69ZP3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PnkdQ69ZP3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PnkdQ69ZP3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PnkdQ69ZP3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PnkdQ69ZP3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PnkdQ69ZP3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PnkdQ69ZP3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PnkdQ69ZP3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PnkdQ69ZP3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PnkdQ69ZP3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PnkdQ69ZP3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PnkdQ69ZP3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PnkdQ69ZP3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PnkdQ69ZP3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PnkdQ69ZP3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PnkdQ69ZP3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PnkdQ69ZP3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PnkdQ69ZP3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PnkdQ69ZP3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PnkdQ69ZP3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PnkdQ69ZP3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PnkdQ69ZP3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PnkdQ69ZP3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PnkdQ69ZP3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PnkdQ69ZP3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PnkdQ69ZP3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PnkdQ69ZP3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PnkdQ69ZP3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PnkdQ69ZP3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PnkdQ69ZP3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PnkdQ69ZP3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PnkdQ69ZP3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PnkdQ69ZP3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PnkdQ69ZP3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PnkdQ69ZP3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PnkdQ69ZP3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PnkdQ69ZP3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PnkdQ69ZP3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PnkdQ69ZP3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PnkdQ69ZP3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PnkdQ69ZP3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PnkdQ69ZP3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PnkdQ69ZP3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PnkdQ69ZP3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PnkdQ69ZP3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PnkdQ69ZP3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PnkdQ69ZP3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PnkdQ69ZP3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PnkdQ69ZP3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PnkdQ69ZP3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PnkdQ69ZP3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PnkdQ69ZP3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PnkdQ69ZP3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PnkdQ69ZP3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PnkdQ69ZP3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PnkdQ69ZP3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PnkdQ69ZP3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PnkdQ69ZP3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PnkdQ69ZP3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PnkdQ69ZP3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PnkdQ69ZP3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PnkdQ69ZP3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PnkdQ69ZP3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PnkdQ69ZP3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PnkdQ69ZP3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PnkdQ69ZP3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PnkdQ69ZP3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PnkdQ69ZP3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PnkdQ69ZP3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PnkdQ69ZP3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PnkdQ69ZP3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PnkdQ69ZP3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PnkdQ69ZP3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PnkdQ69ZP3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PnkdQ69ZP3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PnkdQ69ZP3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PnkdQ69ZP3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PnkdQ69ZP3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PnkdQ69ZP3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PnkdQ69ZP3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PnkdQ69ZP3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PnkdQ69ZP3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PnkdQ69ZP3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PnkdQ69ZP3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PnkdQ69ZP3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PnkdQ69ZP3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 288.9 ms