Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Sbno1Q689Z5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sbno1Q689Z5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sbno1Q689Z5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sbno1Q689Z5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sbno1Q689Z5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sbno1Q689Z5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sbno1Q689Z5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sbno1Q689Z5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Sbno1Q689Z5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sbno1Q689Z5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sbno1Q689Z5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sbno1Q689Z5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sbno1Q689Z5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sbno1Q689Z5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sbno1Q689Z5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sbno1Q689Z5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Sbno1Q689Z5 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sbno1Q689Z5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sbno1Q689Z5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sbno1Q689Z5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Sbno1Q689Z5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sbno1Q689Z5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sbno1Q689Z5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sbno1Q689Z5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Sbno1Q689Z5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sbno1Q689Z5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sbno1Q689Z5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sbno1Q689Z5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sbno1Q689Z5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sbno1Q689Z5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sbno1Q689Z5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sbno1Q689Z5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sbno1Q689Z5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sbno1Q689Z5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sbno1Q689Z5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Sbno1Q689Z5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sbno1Q689Z5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sbno1Q689Z5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sbno1Q689Z5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sbno1Q689Z5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Sbno1Q689Z5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Sbno1Q689Z5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Sbno1Q689Z5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sbno1Q689Z5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sbno1Q689Z5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sbno1Q689Z5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sbno1Q689Z5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sbno1Q689Z5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sbno1Q689Z5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sbno1Q689Z5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sbno1Q689Z5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sbno1Q689Z5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sbno1Q689Z5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sbno1Q689Z5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sbno1Q689Z5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sbno1Q689Z5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sbno1Q689Z5 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sbno1Q689Z5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sbno1Q689Z5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sbno1Q689Z5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sbno1Q689Z5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sbno1Q689Z5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sbno1Q689Z5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sbno1Q689Z5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sbno1Q689Z5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sbno1Q689Z5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sbno1Q689Z5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Sbno1Q689Z5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sbno1Q689Z5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sbno1Q689Z5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sbno1Q689Z5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sbno1Q689Z5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sbno1Q689Z5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sbno1Q689Z5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sbno1Q689Z5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sbno1Q689Z5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sbno1Q689Z5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sbno1Q689Z5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sbno1Q689Z5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sbno1Q689Z5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sbno1Q689Z5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sbno1Q689Z5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sbno1Q689Z5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sbno1Q689Z5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sbno1Q689Z5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sbno1Q689Z5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sbno1Q689Z5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sbno1Q689Z5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sbno1Q689Z5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Sbno1Q689Z5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Sbno1Q689Z5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sbno1Q689Z5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sbno1Q689Z5 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Sbno1Q689Z5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sbno1Q689Z5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sbno1Q689Z5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sbno1Q689Z5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sbno1Q689Z5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sbno1Q689Z5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.1 ms