Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctnna3Q65CL1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctnna3Q65CL1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctnna3Q65CL1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctnna3Q65CL1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctnna3Q65CL1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctnna3Q65CL1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctnna3Q65CL1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctnna3Q65CL1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctnna3Q65CL1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctnna3Q65CL1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctnna3Q65CL1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctnna3Q65CL1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctnna3Q65CL1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctnna3Q65CL1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctnna3Q65CL1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctnna3Q65CL1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctnna3Q65CL1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctnna3Q65CL1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctnna3Q65CL1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctnna3Q65CL1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctnna3Q65CL1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctnna3Q65CL1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctnna3Q65CL1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctnna3Q65CL1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctnna3Q65CL1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctnna3Q65CL1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctnna3Q65CL1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctnna3Q65CL1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctnna3Q65CL1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctnna3Q65CL1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctnna3Q65CL1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctnna3Q65CL1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctnna3Q65CL1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctnna3Q65CL1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctnna3Q65CL1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctnna3Q65CL1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctnna3Q65CL1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctnna3Q65CL1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctnna3Q65CL1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctnna3Q65CL1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ctnna3Q65CL1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ctnna3Q65CL1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ctnna3Q65CL1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ctnna3Q65CL1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ctnna3Q65CL1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ctnna3Q65CL1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ctnna3Q65CL1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ctnna3Q65CL1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctnna3Q65CL1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctnna3Q65CL1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctnna3Q65CL1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctnna3Q65CL1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctnna3Q65CL1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctnna3Q65CL1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctnna3Q65CL1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctnna3Q65CL1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctnna3Q65CL1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctnna3Q65CL1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctnna3Q65CL1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctnna3Q65CL1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctnna3Q65CL1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctnna3Q65CL1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctnna3Q65CL1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctnna3Q65CL1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctnna3Q65CL1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctnna3Q65CL1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctnna3Q65CL1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctnna3Q65CL1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctnna3Q65CL1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctnna3Q65CL1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctnna3Q65CL1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctnna3Q65CL1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctnna3Q65CL1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctnna3Q65CL1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctnna3Q65CL1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctnna3Q65CL1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctnna3Q65CL1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctnna3Q65CL1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctnna3Q65CL1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctnna3Q65CL1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctnna3Q65CL1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctnna3Q65CL1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctnna3Q65CL1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctnna3Q65CL1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctnna3Q65CL1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctnna3Q65CL1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctnna3Q65CL1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctnna3Q65CL1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctnna3Q65CL1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctnna3Q65CL1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctnna3Q65CL1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctnna3Q65CL1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctnna3Q65CL1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctnna3Q65CL1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctnna3Q65CL1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctnna3Q65CL1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctnna3Q65CL1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctnna3Q65CL1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctnna3Q65CL1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms