Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Top2bQ64511 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Top2bQ64511 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Top2bQ64511 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.86
Top2bQ64511 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC32.95■■■□□ 2.86
Top2bQ64511 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.86
Top2bQ64511 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Top2bQ64511 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Top2bQ64511 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Top2bQ64511 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Top2bQ64511 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Top2bQ64511 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Top2bQ64511 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Top2bQ64511 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Top2bQ64511 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Top2bQ64511 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Top2bQ64511 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Top2bQ64511 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Top2bQ64511 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Top2bQ64511 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Top2bQ64511 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Top2bQ64511 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Top2bQ64511 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
Top2bQ64511 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
Top2bQ64511 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Top2bQ64511 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Top2bQ64511 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Top2bQ64511 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Top2bQ64511 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Top2bQ64511 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Top2bQ64511 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Top2bQ64511 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Top2bQ64511 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Top2bQ64511 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Top2bQ64511 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Top2bQ64511 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Top2bQ64511 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Top2bQ64511 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Top2bQ64511 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Top2bQ64511 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Top2bQ64511 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Top2bQ64511 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Top2bQ64511 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Top2bQ64511 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
Top2bQ64511 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Top2bQ64511 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
Top2bQ64511 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Top2bQ64511 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Top2bQ64511 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Top2bQ64511 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Top2bQ64511 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Top2bQ64511 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Top2bQ64511 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Top2bQ64511 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Top2bQ64511 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
Top2bQ64511 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Top2bQ64511 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Top2bQ64511 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Top2bQ64511 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Top2bQ64511 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
Top2bQ64511 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Top2bQ64511 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Top2bQ64511 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Top2bQ64511 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Top2bQ64511 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Top2bQ64511 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
Top2bQ64511 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
Top2bQ64511 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
Top2bQ64511 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
Top2bQ64511 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
Top2bQ64511 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
Top2bQ64511 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Top2bQ64511 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Top2bQ64511 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Top2bQ64511 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Top2bQ64511 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Top2bQ64511 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Top2bQ64511 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Top2bQ64511 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Top2bQ64511 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Top2bQ64511 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
Top2bQ64511 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Top2bQ64511 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Top2bQ64511 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Top2bQ64511 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
Top2bQ64511 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
Top2bQ64511 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Top2bQ64511 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Top2bQ64511 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Top2bQ64511 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Top2bQ64511 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Top2bQ64511 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Top2bQ64511 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Top2bQ64511 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Top2bQ64511 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Top2bQ64511 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
Top2bQ64511 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Top2bQ64511 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Top2bQ64511 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Top2bQ64511 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms