Protein–RNA interactions for Protein: Q63955

Pou4f3, POU domain, class 4, transcription factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f3Q63955 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms