Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Itga3Q62470 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Itga3Q62470 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itga3Q62470 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itga3Q62470 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itga3Q62470 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Itga3Q62470 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itga3Q62470 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itga3Q62470 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itga3Q62470 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itga3Q62470 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itga3Q62470 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Itga3Q62470 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itga3Q62470 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itga3Q62470 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Itga3Q62470 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itga3Q62470 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itga3Q62470 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itga3Q62470 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itga3Q62470 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itga3Q62470 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Itga3Q62470 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itga3Q62470 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itga3Q62470 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itga3Q62470 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itga3Q62470 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itga3Q62470 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itga3Q62470 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itga3Q62470 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itga3Q62470 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itga3Q62470 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itga3Q62470 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itga3Q62470 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itga3Q62470 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itga3Q62470 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itga3Q62470 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itga3Q62470 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itga3Q62470 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itga3Q62470 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itga3Q62470 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Itga3Q62470 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itga3Q62470 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itga3Q62470 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itga3Q62470 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itga3Q62470 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itga3Q62470 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itga3Q62470 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itga3Q62470 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itga3Q62470 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itga3Q62470 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itga3Q62470 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itga3Q62470 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itga3Q62470 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itga3Q62470 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itga3Q62470 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itga3Q62470 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Itga3Q62470 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Itga3Q62470 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Itga3Q62470 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Itga3Q62470 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Itga3Q62470 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Itga3Q62470 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Itga3Q62470 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Itga3Q62470 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Itga3Q62470 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Itga3Q62470 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itga3Q62470 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itga3Q62470 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itga3Q62470 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itga3Q62470 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itga3Q62470 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itga3Q62470 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itga3Q62470 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itga3Q62470 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itga3Q62470 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Itga3Q62470 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Itga3Q62470 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Itga3Q62470 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Itga3Q62470 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Itga3Q62470 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Itga3Q62470 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Itga3Q62470 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itga3Q62470 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itga3Q62470 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itga3Q62470 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itga3Q62470 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itga3Q62470 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itga3Q62470 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itga3Q62470 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itga3Q62470 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itga3Q62470 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itga3Q62470 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itga3Q62470 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itga3Q62470 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itga3Q62470 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itga3Q62470 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itga3Q62470 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itga3Q62470 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itga3Q62470 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itga3Q62470 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms