Protein–RNA interactions for Protein: Q62468

Vil1, Villin-1, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vil1Q62468 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vil1Q62468 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vil1Q62468 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vil1Q62468 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vil1Q62468 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vil1Q62468 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vil1Q62468 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vil1Q62468 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vil1Q62468 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vil1Q62468 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vil1Q62468 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vil1Q62468 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vil1Q62468 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vil1Q62468 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Vil1Q62468 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Vil1Q62468 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vil1Q62468 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vil1Q62468 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vil1Q62468 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vil1Q62468 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vil1Q62468 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vil1Q62468 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vil1Q62468 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vil1Q62468 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vil1Q62468 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vil1Q62468 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vil1Q62468 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vil1Q62468 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vil1Q62468 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vil1Q62468 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vil1Q62468 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vil1Q62468 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vil1Q62468 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vil1Q62468 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vil1Q62468 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vil1Q62468 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vil1Q62468 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vil1Q62468 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vil1Q62468 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vil1Q62468 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vil1Q62468 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vil1Q62468 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vil1Q62468 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vil1Q62468 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vil1Q62468 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vil1Q62468 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vil1Q62468 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vil1Q62468 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vil1Q62468 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vil1Q62468 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vil1Q62468 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vil1Q62468 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vil1Q62468 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Vil1Q62468 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vil1Q62468 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vil1Q62468 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vil1Q62468 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vil1Q62468 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Vil1Q62468 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vil1Q62468 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vil1Q62468 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vil1Q62468 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vil1Q62468 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vil1Q62468 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vil1Q62468 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vil1Q62468 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vil1Q62468 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vil1Q62468 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vil1Q62468 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vil1Q62468 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vil1Q62468 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vil1Q62468 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vil1Q62468 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vil1Q62468 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vil1Q62468 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vil1Q62468 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vil1Q62468 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vil1Q62468 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vil1Q62468 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vil1Q62468 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vil1Q62468 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vil1Q62468 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vil1Q62468 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vil1Q62468 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vil1Q62468 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vil1Q62468 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vil1Q62468 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vil1Q62468 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vil1Q62468 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Vil1Q62468 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vil1Q62468 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vil1Q62468 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vil1Q62468 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vil1Q62468 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vil1Q62468 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vil1Q62468 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Vil1Q62468 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vil1Q62468 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vil1Q62468 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vil1Q62468 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms