Protein–RNA interactions for Protein: Q62401

Ccl12, C-C motif chemokine 12, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl12Q62401 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl12Q62401 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl12Q62401 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl12Q62401 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl12Q62401 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl12Q62401 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl12Q62401 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl12Q62401 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl12Q62401 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl12Q62401 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl12Q62401 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl12Q62401 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl12Q62401 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl12Q62401 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl12Q62401 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl12Q62401 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl12Q62401 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl12Q62401 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl12Q62401 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl12Q62401 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl12Q62401 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl12Q62401 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl12Q62401 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl12Q62401 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl12Q62401 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl12Q62401 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl12Q62401 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl12Q62401 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl12Q62401 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl12Q62401 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl12Q62401 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl12Q62401 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl12Q62401 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl12Q62401 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl12Q62401 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl12Q62401 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl12Q62401 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl12Q62401 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl12Q62401 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl12Q62401 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl12Q62401 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl12Q62401 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl12Q62401 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl12Q62401 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl12Q62401 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl12Q62401 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl12Q62401 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl12Q62401 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl12Q62401 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl12Q62401 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl12Q62401 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl12Q62401 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl12Q62401 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl12Q62401 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl12Q62401 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl12Q62401 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl12Q62401 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl12Q62401 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl12Q62401 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl12Q62401 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl12Q62401 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl12Q62401 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl12Q62401 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl12Q62401 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl12Q62401 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl12Q62401 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl12Q62401 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl12Q62401 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl12Q62401 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl12Q62401 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl12Q62401 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl12Q62401 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl12Q62401 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl12Q62401 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl12Q62401 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl12Q62401 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl12Q62401 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl12Q62401 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl12Q62401 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl12Q62401 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl12Q62401 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl12Q62401 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms