Protein–RNA interactions for Protein: Q62241

Snrpc, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpcQ62241 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpcQ62241 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpcQ62241 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpcQ62241 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpcQ62241 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpcQ62241 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpcQ62241 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpcQ62241 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpcQ62241 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpcQ62241 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpcQ62241 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpcQ62241 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpcQ62241 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpcQ62241 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpcQ62241 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpcQ62241 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpcQ62241 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpcQ62241 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpcQ62241 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpcQ62241 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpcQ62241 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpcQ62241 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpcQ62241 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpcQ62241 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms