Protein–RNA interactions for Protein: Q62186

Ssr4, Translocon-associated protein subunit delta, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr4Q62186 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ssr4Q62186 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ssr4Q62186 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ssr4Q62186 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ssr4Q62186 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ssr4Q62186 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ssr4Q62186 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ssr4Q62186 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ssr4Q62186 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ssr4Q62186 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ssr4Q62186 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ssr4Q62186 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ssr4Q62186 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ssr4Q62186 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ssr4Q62186 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ssr4Q62186 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ssr4Q62186 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ssr4Q62186 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ssr4Q62186 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ssr4Q62186 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ssr4Q62186 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ssr4Q62186 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ssr4Q62186 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ssr4Q62186 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ssr4Q62186 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ssr4Q62186 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ssr4Q62186 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ssr4Q62186 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ssr4Q62186 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ssr4Q62186 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ssr4Q62186 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ssr4Q62186 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ssr4Q62186 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ssr4Q62186 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ssr4Q62186 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ssr4Q62186 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Ssr4Q62186 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ssr4Q62186 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ssr4Q62186 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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Ssr4Q62186 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Ssr4Q62186 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ssr4Q62186 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Ssr4Q62186 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ssr4Q62186 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Ssr4Q62186 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ssr4Q62186 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ssr4Q62186 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Ssr4Q62186 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Ssr4Q62186 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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Ssr4Q62186 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ssr4Q62186 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ssr4Q62186 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ssr4Q62186 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ssr4Q62186 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ssr4Q62186 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ssr4Q62186 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ssr4Q62186 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ssr4Q62186 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ssr4Q62186 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ssr4Q62186 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ssr4Q62186 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ssr4Q62186 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ssr4Q62186 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ssr4Q62186 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ssr4Q62186 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ssr4Q62186 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ssr4Q62186 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ssr4Q62186 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ssr4Q62186 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ssr4Q62186 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ssr4Q62186 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ssr4Q62186 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ssr4Q62186 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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