Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Odf1Q61999 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Odf1Q61999 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Odf1Q61999 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Odf1Q61999 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Odf1Q61999 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Odf1Q61999 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Odf1Q61999 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Odf1Q61999 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Odf1Q61999 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Odf1Q61999 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Odf1Q61999 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Odf1Q61999 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Odf1Q61999 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Odf1Q61999 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Odf1Q61999 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Odf1Q61999 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Odf1Q61999 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Odf1Q61999 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Odf1Q61999 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Odf1Q61999 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Odf1Q61999 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Odf1Q61999 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Odf1Q61999 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Odf1Q61999 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Odf1Q61999 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Odf1Q61999 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Odf1Q61999 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Odf1Q61999 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Odf1Q61999 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Odf1Q61999 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Odf1Q61999 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Odf1Q61999 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Odf1Q61999 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Odf1Q61999 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Odf1Q61999 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Odf1Q61999 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Odf1Q61999 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Odf1Q61999 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Odf1Q61999 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Odf1Q61999 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Odf1Q61999 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Odf1Q61999 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Odf1Q61999 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Odf1Q61999 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Odf1Q61999 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Odf1Q61999 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Odf1Q61999 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Odf1Q61999 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Odf1Q61999 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Odf1Q61999 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Odf1Q61999 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Odf1Q61999 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Odf1Q61999 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Odf1Q61999 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Odf1Q61999 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Odf1Q61999 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Odf1Q61999 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Odf1Q61999 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Odf1Q61999 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Odf1Q61999 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Odf1Q61999 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Odf1Q61999 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Odf1Q61999 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Odf1Q61999 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf1Q61999 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf1Q61999 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf1Q61999 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf1Q61999 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf1Q61999 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf1Q61999 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf1Q61999 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Odf1Q61999 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Odf1Q61999 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Odf1Q61999 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Odf1Q61999 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Odf1Q61999 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Odf1Q61999 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Odf1Q61999 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Odf1Q61999 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Odf1Q61999 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Odf1Q61999 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Odf1Q61999 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Odf1Q61999 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Odf1Q61999 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Odf1Q61999 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Odf1Q61999 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Odf1Q61999 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Odf1Q61999 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Odf1Q61999 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Odf1Q61999 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Odf1Q61999 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms