Protein–RNA interactions for Protein: Q61897

Krt33b, Keratin, type I cuticular Ha3-II, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt33bQ61897 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt33bQ61897 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Krt33bQ61897 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt33bQ61897 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt33bQ61897 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt33bQ61897 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt33bQ61897 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt33bQ61897 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt33bQ61897 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt33bQ61897 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt33bQ61897 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt33bQ61897 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt33bQ61897 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt33bQ61897 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt33bQ61897 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt33bQ61897 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt33bQ61897 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt33bQ61897 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt33bQ61897 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt33bQ61897 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt33bQ61897 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt33bQ61897 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt33bQ61897 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt33bQ61897 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt33bQ61897 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt33bQ61897 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt33bQ61897 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt33bQ61897 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt33bQ61897 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt33bQ61897 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt33bQ61897 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt33bQ61897 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt33bQ61897 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt33bQ61897 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt33bQ61897 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt33bQ61897 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt33bQ61897 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt33bQ61897 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt33bQ61897 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt33bQ61897 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt33bQ61897 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt33bQ61897 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt33bQ61897 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms