Protein–RNA interactions for Protein: Q61878

Prg2, Bone marrow proteoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg2Q61878 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prg2Q61878 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prg2Q61878 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Prg2Q61878 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Prg2Q61878 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Prg2Q61878 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prg2Q61878 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prg2Q61878 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prg2Q61878 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prg2Q61878 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prg2Q61878 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prg2Q61878 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prg2Q61878 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prg2Q61878 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prg2Q61878 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prg2Q61878 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Prg2Q61878 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prg2Q61878 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prg2Q61878 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prg2Q61878 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prg2Q61878 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prg2Q61878 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prg2Q61878 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prg2Q61878 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prg2Q61878 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prg2Q61878 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prg2Q61878 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prg2Q61878 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prg2Q61878 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prg2Q61878 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Prg2Q61878 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prg2Q61878 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prg2Q61878 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prg2Q61878 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prg2Q61878 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prg2Q61878 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prg2Q61878 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prg2Q61878 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prg2Q61878 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prg2Q61878 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prg2Q61878 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prg2Q61878 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prg2Q61878 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Prg2Q61878 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prg2Q61878 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prg2Q61878 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prg2Q61878 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prg2Q61878 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prg2Q61878 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prg2Q61878 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prg2Q61878 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prg2Q61878 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prg2Q61878 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prg2Q61878 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Prg2Q61878 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Prg2Q61878 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prg2Q61878 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prg2Q61878 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Prg2Q61878 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prg2Q61878 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prg2Q61878 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prg2Q61878 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prg2Q61878 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prg2Q61878 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prg2Q61878 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prg2Q61878 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prg2Q61878 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prg2Q61878 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Prg2Q61878 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prg2Q61878 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prg2Q61878 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prg2Q61878 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prg2Q61878 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prg2Q61878 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prg2Q61878 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prg2Q61878 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prg2Q61878 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prg2Q61878 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prg2Q61878 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prg2Q61878 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prg2Q61878 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prg2Q61878 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prg2Q61878 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prg2Q61878 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prg2Q61878 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prg2Q61878 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prg2Q61878 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prg2Q61878 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prg2Q61878 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prg2Q61878 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prg2Q61878 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prg2Q61878 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Prg2Q61878 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Prg2Q61878 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prg2Q61878 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prg2Q61878 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prg2Q61878 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prg2Q61878 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prg2Q61878 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prg2Q61878 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms