Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Msi1Q61474 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Msi1Q61474 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Msi1Q61474 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Msi1Q61474 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Msi1Q61474 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Msi1Q61474 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Msi1Q61474 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Msi1Q61474 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Msi1Q61474 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Msi1Q61474 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Msi1Q61474 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msi1Q61474 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msi1Q61474 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msi1Q61474 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Msi1Q61474 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msi1Q61474 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msi1Q61474 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msi1Q61474 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msi1Q61474 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msi1Q61474 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msi1Q61474 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msi1Q61474 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msi1Q61474 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msi1Q61474 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msi1Q61474 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msi1Q61474 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msi1Q61474 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msi1Q61474 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msi1Q61474 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msi1Q61474 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msi1Q61474 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msi1Q61474 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msi1Q61474 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msi1Q61474 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msi1Q61474 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msi1Q61474 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msi1Q61474 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msi1Q61474 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msi1Q61474 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msi1Q61474 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msi1Q61474 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msi1Q61474 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Msi1Q61474 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msi1Q61474 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msi1Q61474 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Msi1Q61474 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msi1Q61474 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msi1Q61474 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msi1Q61474 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msi1Q61474 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msi1Q61474 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Msi1Q61474 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Msi1Q61474 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Msi1Q61474 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Msi1Q61474 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Msi1Q61474 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Msi1Q61474 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Msi1Q61474 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Msi1Q61474 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Msi1Q61474 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Msi1Q61474 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Msi1Q61474 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Msi1Q61474 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Msi1Q61474 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Msi1Q61474 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Msi1Q61474 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Msi1Q61474 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Msi1Q61474 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Msi1Q61474 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Msi1Q61474 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Msi1Q61474 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Msi1Q61474 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Msi1Q61474 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Msi1Q61474 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Msi1Q61474 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Msi1Q61474 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Msi1Q61474 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Msi1Q61474 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Msi1Q61474 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Msi1Q61474 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Msi1Q61474 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Msi1Q61474 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Msi1Q61474 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Msi1Q61474 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Msi1Q61474 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Msi1Q61474 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Msi1Q61474 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Msi1Q61474 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Msi1Q61474 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Msi1Q61474 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Msi1Q61474 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Msi1Q61474 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Msi1Q61474 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Msi1Q61474 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Msi1Q61474 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Msi1Q61474 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Msi1Q61474 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Msi1Q61474 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Msi1Q61474 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms