Protein–RNA interactions for Protein: Q61409

Pde3b, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde3bQ61409 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pde3bQ61409 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pde3bQ61409 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pde3bQ61409 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pde3bQ61409 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pde3bQ61409 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pde3bQ61409 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pde3bQ61409 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pde3bQ61409 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pde3bQ61409 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pde3bQ61409 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pde3bQ61409 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pde3bQ61409 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pde3bQ61409 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pde3bQ61409 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pde3bQ61409 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pde3bQ61409 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pde3bQ61409 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pde3bQ61409 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pde3bQ61409 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pde3bQ61409 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pde3bQ61409 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pde3bQ61409 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pde3bQ61409 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pde3bQ61409 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pde3bQ61409 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pde3bQ61409 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pde3bQ61409 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pde3bQ61409 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pde3bQ61409 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pde3bQ61409 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pde3bQ61409 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pde3bQ61409 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pde3bQ61409 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pde3bQ61409 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pde3bQ61409 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pde3bQ61409 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pde3bQ61409 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pde3bQ61409 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pde3bQ61409 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pde3bQ61409 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pde3bQ61409 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Pde3bQ61409 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pde3bQ61409 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pde3bQ61409 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Pde3bQ61409 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pde3bQ61409 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Pde3bQ61409 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pde3bQ61409 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pde3bQ61409 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Pde3bQ61409 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pde3bQ61409 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pde3bQ61409 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pde3bQ61409 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pde3bQ61409 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pde3bQ61409 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pde3bQ61409 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pde3bQ61409 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pde3bQ61409 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pde3bQ61409 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pde3bQ61409 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pde3bQ61409 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pde3bQ61409 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pde3bQ61409 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pde3bQ61409 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pde3bQ61409 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pde3bQ61409 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pde3bQ61409 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pde3bQ61409 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pde3bQ61409 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pde3bQ61409 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pde3bQ61409 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pde3bQ61409 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pde3bQ61409 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pde3bQ61409 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pde3bQ61409 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pde3bQ61409 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pde3bQ61409 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pde3bQ61409 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pde3bQ61409 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Pde3bQ61409 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pde3bQ61409 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pde3bQ61409 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pde3bQ61409 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pde3bQ61409 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pde3bQ61409 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pde3bQ61409 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pde3bQ61409 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pde3bQ61409 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pde3bQ61409 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pde3bQ61409 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pde3bQ61409 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pde3bQ61409 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Pde3bQ61409 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Pde3bQ61409 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pde3bQ61409 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pde3bQ61409 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Pde3bQ61409 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pde3bQ61409 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pde3bQ61409 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms