Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PcolceQ61398 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PcolceQ61398 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PcolceQ61398 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PcolceQ61398 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PcolceQ61398 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PcolceQ61398 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PcolceQ61398 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PcolceQ61398 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PcolceQ61398 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PcolceQ61398 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PcolceQ61398 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PcolceQ61398 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PcolceQ61398 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PcolceQ61398 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PcolceQ61398 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PcolceQ61398 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PcolceQ61398 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PcolceQ61398 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PcolceQ61398 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PcolceQ61398 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PcolceQ61398 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PcolceQ61398 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PcolceQ61398 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PcolceQ61398 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PcolceQ61398 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PcolceQ61398 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PcolceQ61398 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PcolceQ61398 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PcolceQ61398 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PcolceQ61398 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PcolceQ61398 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PcolceQ61398 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PcolceQ61398 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PcolceQ61398 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PcolceQ61398 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PcolceQ61398 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PcolceQ61398 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PcolceQ61398 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PcolceQ61398 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PcolceQ61398 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PcolceQ61398 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PcolceQ61398 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PcolceQ61398 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PcolceQ61398 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PcolceQ61398 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PcolceQ61398 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PcolceQ61398 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PcolceQ61398 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PcolceQ61398 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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PcolceQ61398 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PcolceQ61398 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PcolceQ61398 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PcolceQ61398 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PcolceQ61398 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PcolceQ61398 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PcolceQ61398 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PcolceQ61398 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PcolceQ61398 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PcolceQ61398 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PcolceQ61398 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PcolceQ61398 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PcolceQ61398 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PcolceQ61398 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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PcolceQ61398 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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PcolceQ61398 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PcolceQ61398 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PcolceQ61398 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PcolceQ61398 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PcolceQ61398 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PcolceQ61398 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PcolceQ61398 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PcolceQ61398 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PcolceQ61398 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PcolceQ61398 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PcolceQ61398 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PcolceQ61398 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PcolceQ61398 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PcolceQ61398 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PcolceQ61398 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PcolceQ61398 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PcolceQ61398 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PcolceQ61398 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PcolceQ61398 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PcolceQ61398 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PcolceQ61398 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PcolceQ61398 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PcolceQ61398 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PcolceQ61398 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PcolceQ61398 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PcolceQ61398 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PcolceQ61398 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PcolceQ61398 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PcolceQ61398 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PcolceQ61398 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PcolceQ61398 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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