Protein–RNA interactions for Protein: Q61220

Nell2, Protein kinase C-binding protein NELL2, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nell2Q61220 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nell2Q61220 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nell2Q61220 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nell2Q61220 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nell2Q61220 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nell2Q61220 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Nell2Q61220 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nell2Q61220 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nell2Q61220 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nell2Q61220 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nell2Q61220 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nell2Q61220 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nell2Q61220 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nell2Q61220 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nell2Q61220 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nell2Q61220 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nell2Q61220 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nell2Q61220 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nell2Q61220 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nell2Q61220 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Nell2Q61220 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nell2Q61220 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nell2Q61220 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nell2Q61220 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nell2Q61220 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nell2Q61220 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nell2Q61220 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nell2Q61220 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nell2Q61220 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nell2Q61220 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nell2Q61220 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Nell2Q61220 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nell2Q61220 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nell2Q61220 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nell2Q61220 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nell2Q61220 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nell2Q61220 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nell2Q61220 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Nell2Q61220 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nell2Q61220 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nell2Q61220 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nell2Q61220 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nell2Q61220 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nell2Q61220 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nell2Q61220 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nell2Q61220 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nell2Q61220 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nell2Q61220 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nell2Q61220 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nell2Q61220 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nell2Q61220 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nell2Q61220 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nell2Q61220 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nell2Q61220 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nell2Q61220 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nell2Q61220 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nell2Q61220 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nell2Q61220 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nell2Q61220 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nell2Q61220 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nell2Q61220 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Nell2Q61220 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nell2Q61220 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Nell2Q61220 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nell2Q61220 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nell2Q61220 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nell2Q61220 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nell2Q61220 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nell2Q61220 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nell2Q61220 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nell2Q61220 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nell2Q61220 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nell2Q61220 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nell2Q61220 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nell2Q61220 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nell2Q61220 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nell2Q61220 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Nell2Q61220 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nell2Q61220 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nell2Q61220 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nell2Q61220 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nell2Q61220 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nell2Q61220 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nell2Q61220 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nell2Q61220 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nell2Q61220 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nell2Q61220 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nell2Q61220 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nell2Q61220 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nell2Q61220 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nell2Q61220 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nell2Q61220 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nell2Q61220 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nell2Q61220 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nell2Q61220 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nell2Q61220 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nell2Q61220 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nell2Q61220 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nell2Q61220 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nell2Q61220 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms