Protein–RNA interactions for Protein: Q61136

Prpf4b, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4bQ61136 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prpf4bQ61136 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prpf4bQ61136 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Prpf4bQ61136 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prpf4bQ61136 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prpf4bQ61136 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prpf4bQ61136 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Prpf4bQ61136 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prpf4bQ61136 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prpf4bQ61136 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prpf4bQ61136 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prpf4bQ61136 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prpf4bQ61136 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prpf4bQ61136 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prpf4bQ61136 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prpf4bQ61136 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prpf4bQ61136 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prpf4bQ61136 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prpf4bQ61136 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prpf4bQ61136 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prpf4bQ61136 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prpf4bQ61136 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prpf4bQ61136 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prpf4bQ61136 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prpf4bQ61136 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prpf4bQ61136 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prpf4bQ61136 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prpf4bQ61136 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prpf4bQ61136 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prpf4bQ61136 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prpf4bQ61136 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prpf4bQ61136 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prpf4bQ61136 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prpf4bQ61136 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prpf4bQ61136 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prpf4bQ61136 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prpf4bQ61136 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prpf4bQ61136 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prpf4bQ61136 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prpf4bQ61136 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prpf4bQ61136 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prpf4bQ61136 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prpf4bQ61136 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prpf4bQ61136 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prpf4bQ61136 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prpf4bQ61136 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prpf4bQ61136 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prpf4bQ61136 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Prpf4bQ61136 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prpf4bQ61136 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Prpf4bQ61136 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prpf4bQ61136 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prpf4bQ61136 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prpf4bQ61136 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prpf4bQ61136 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prpf4bQ61136 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prpf4bQ61136 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prpf4bQ61136 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prpf4bQ61136 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prpf4bQ61136 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prpf4bQ61136 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prpf4bQ61136 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpf4bQ61136 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpf4bQ61136 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpf4bQ61136 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpf4bQ61136 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpf4bQ61136 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpf4bQ61136 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpf4bQ61136 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpf4bQ61136 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpf4bQ61136 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpf4bQ61136 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpf4bQ61136 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpf4bQ61136 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpf4bQ61136 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpf4bQ61136 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpf4bQ61136 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prpf4bQ61136 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Prpf4bQ61136 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prpf4bQ61136 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prpf4bQ61136 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prpf4bQ61136 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Prpf4bQ61136 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prpf4bQ61136 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prpf4bQ61136 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpf4bQ61136 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpf4bQ61136 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpf4bQ61136 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpf4bQ61136 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpf4bQ61136 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpf4bQ61136 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpf4bQ61136 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpf4bQ61136 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpf4bQ61136 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpf4bQ61136 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpf4bQ61136 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Prpf4bQ61136 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Prpf4bQ61136 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prpf4bQ61136 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prpf4bQ61136 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms