Protein–RNA interactions for Protein: Q61107

Gbp4, Guanylate-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4Q61107 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gbp4Q61107 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gbp4Q61107 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gbp4Q61107 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gbp4Q61107 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gbp4Q61107 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gbp4Q61107 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gbp4Q61107 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gbp4Q61107 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gbp4Q61107 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gbp4Q61107 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gbp4Q61107 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gbp4Q61107 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gbp4Q61107 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gbp4Q61107 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gbp4Q61107 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gbp4Q61107 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gbp4Q61107 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gbp4Q61107 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gbp4Q61107 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gbp4Q61107 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gbp4Q61107 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gbp4Q61107 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gbp4Q61107 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gbp4Q61107 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gbp4Q61107 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gbp4Q61107 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gbp4Q61107 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gbp4Q61107 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gbp4Q61107 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gbp4Q61107 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gbp4Q61107 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gbp4Q61107 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gbp4Q61107 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gbp4Q61107 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gbp4Q61107 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Gbp4Q61107 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gbp4Q61107 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gbp4Q61107 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gbp4Q61107 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gbp4Q61107 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gbp4Q61107 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gbp4Q61107 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gbp4Q61107 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gbp4Q61107 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gbp4Q61107 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Gbp4Q61107 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Gbp4Q61107 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gbp4Q61107 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Gbp4Q61107 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gbp4Q61107 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gbp4Q61107 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gbp4Q61107 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gbp4Q61107 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gbp4Q61107 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gbp4Q61107 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gbp4Q61107 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gbp4Q61107 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gbp4Q61107 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gbp4Q61107 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gbp4Q61107 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gbp4Q61107 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gbp4Q61107 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gbp4Q61107 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gbp4Q61107 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gbp4Q61107 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gbp4Q61107 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gbp4Q61107 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Gbp4Q61107 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gbp4Q61107 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gbp4Q61107 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gbp4Q61107 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gbp4Q61107 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gbp4Q61107 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gbp4Q61107 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gbp4Q61107 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gbp4Q61107 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gbp4Q61107 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gbp4Q61107 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gbp4Q61107 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gbp4Q61107 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gbp4Q61107 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Gbp4Q61107 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gbp4Q61107 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gbp4Q61107 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gbp4Q61107 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gbp4Q61107 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gbp4Q61107 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gbp4Q61107 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gbp4Q61107 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gbp4Q61107 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gbp4Q61107 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gbp4Q61107 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gbp4Q61107 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gbp4Q61107 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gbp4Q61107 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gbp4Q61107 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gbp4Q61107 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gbp4Q61107 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gbp4Q61107 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms