Protein–RNA interactions for Protein: Q61033

Tmpo, Lamina-associated polypeptide 2, isoforms alpha/zeta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TmpoQ61033 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TmpoQ61033 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TmpoQ61033 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TmpoQ61033 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TmpoQ61033 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TmpoQ61033 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TmpoQ61033 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TmpoQ61033 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TmpoQ61033 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TmpoQ61033 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TmpoQ61033 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TmpoQ61033 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TmpoQ61033 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TmpoQ61033 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TmpoQ61033 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TmpoQ61033 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TmpoQ61033 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TmpoQ61033 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TmpoQ61033 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TmpoQ61033 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TmpoQ61033 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TmpoQ61033 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TmpoQ61033 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TmpoQ61033 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TmpoQ61033 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TmpoQ61033 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TmpoQ61033 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TmpoQ61033 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TmpoQ61033 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TmpoQ61033 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TmpoQ61033 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TmpoQ61033 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TmpoQ61033 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TmpoQ61033 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TmpoQ61033 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TmpoQ61033 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TmpoQ61033 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TmpoQ61033 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TmpoQ61033 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TmpoQ61033 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TmpoQ61033 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TmpoQ61033 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TmpoQ61033 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TmpoQ61033 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TmpoQ61033 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TmpoQ61033 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TmpoQ61033 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TmpoQ61033 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TmpoQ61033 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TmpoQ61033 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TmpoQ61033 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TmpoQ61033 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TmpoQ61033 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TmpoQ61033 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TmpoQ61033 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TmpoQ61033 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TmpoQ61033 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TmpoQ61033 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TmpoQ61033 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TmpoQ61033 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TmpoQ61033 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TmpoQ61033 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TmpoQ61033 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TmpoQ61033 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TmpoQ61033 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TmpoQ61033 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TmpoQ61033 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TmpoQ61033 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TmpoQ61033 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TmpoQ61033 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TmpoQ61033 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TmpoQ61033 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TmpoQ61033 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TmpoQ61033 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TmpoQ61033 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TmpoQ61033 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TmpoQ61033 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TmpoQ61033 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TmpoQ61033 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TmpoQ61033 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TmpoQ61033 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TmpoQ61033 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TmpoQ61033 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TmpoQ61033 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TmpoQ61033 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TmpoQ61033 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TmpoQ61033 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TmpoQ61033 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TmpoQ61033 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TmpoQ61033 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TmpoQ61033 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TmpoQ61033 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TmpoQ61033 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TmpoQ61033 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TmpoQ61033 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TmpoQ61033 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TmpoQ61033 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TmpoQ61033 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TmpoQ61033 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TmpoQ61033 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms