Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbbp4Q60972 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbbp4Q60972 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbbp4Q60972 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbbp4Q60972 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbbp4Q60972 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbbp4Q60972 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbbp4Q60972 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbbp4Q60972 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbbp4Q60972 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbbp4Q60972 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbbp4Q60972 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbbp4Q60972 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbbp4Q60972 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbbp4Q60972 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbbp4Q60972 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbbp4Q60972 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbbp4Q60972 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbbp4Q60972 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbbp4Q60972 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp4Q60972 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp4Q60972 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp4Q60972 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp4Q60972 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp4Q60972 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp4Q60972 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp4Q60972 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp4Q60972 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp4Q60972 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp4Q60972 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp4Q60972 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp4Q60972 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp4Q60972 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp4Q60972 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp4Q60972 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp4Q60972 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp4Q60972 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp4Q60972 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp4Q60972 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp4Q60972 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp4Q60972 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp4Q60972 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp4Q60972 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp4Q60972 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp4Q60972 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp4Q60972 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp4Q60972 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp4Q60972 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp4Q60972 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbbp4Q60972 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbbp4Q60972 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbbp4Q60972 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbbp4Q60972 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbbp4Q60972 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbbp4Q60972 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbbp4Q60972 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbbp4Q60972 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbbp4Q60972 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbbp4Q60972 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbbp4Q60972 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbbp4Q60972 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbbp4Q60972 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbbp4Q60972 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbbp4Q60972 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbbp4Q60972 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbbp4Q60972 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbbp4Q60972 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbbp4Q60972 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Rbbp4Q60972 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rbbp4Q60972 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rbbp4Q60972 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbbp4Q60972 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbbp4Q60972 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbbp4Q60972 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbbp4Q60972 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbbp4Q60972 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbbp4Q60972 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbbp4Q60972 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbbp4Q60972 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbbp4Q60972 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbbp4Q60972 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbbp4Q60972 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbbp4Q60972 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbbp4Q60972 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbbp4Q60972 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbbp4Q60972 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbbp4Q60972 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbbp4Q60972 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbbp4Q60972 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbbp4Q60972 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbbp4Q60972 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbbp4Q60972 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbbp4Q60972 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbbp4Q60972 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbbp4Q60972 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbbp4Q60972 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbbp4Q60972 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbbp4Q60972 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbbp4Q60972 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbbp4Q60972 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms