Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cnot7Q60809 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cnot7Q60809 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Cnot7Q60809 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cnot7Q60809 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cnot7Q60809 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cnot7Q60809 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cnot7Q60809 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cnot7Q60809 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cnot7Q60809 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cnot7Q60809 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cnot7Q60809 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cnot7Q60809 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cnot7Q60809 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cnot7Q60809 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cnot7Q60809 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cnot7Q60809 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cnot7Q60809 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cnot7Q60809 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cnot7Q60809 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cnot7Q60809 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cnot7Q60809 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Cnot7Q60809 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Cnot7Q60809 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Cnot7Q60809 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cnot7Q60809 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cnot7Q60809 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cnot7Q60809 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Cnot7Q60809 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cnot7Q60809 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cnot7Q60809 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cnot7Q60809 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cnot7Q60809 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cnot7Q60809 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Cnot7Q60809 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cnot7Q60809 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cnot7Q60809 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cnot7Q60809 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cnot7Q60809 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cnot7Q60809 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cnot7Q60809 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cnot7Q60809 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cnot7Q60809 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cnot7Q60809 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cnot7Q60809 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cnot7Q60809 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cnot7Q60809 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cnot7Q60809 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cnot7Q60809 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cnot7Q60809 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cnot7Q60809 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cnot7Q60809 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cnot7Q60809 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cnot7Q60809 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cnot7Q60809 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cnot7Q60809 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cnot7Q60809 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cnot7Q60809 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cnot7Q60809 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cnot7Q60809 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnot7Q60809 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnot7Q60809 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnot7Q60809 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnot7Q60809 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnot7Q60809 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnot7Q60809 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnot7Q60809 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnot7Q60809 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnot7Q60809 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnot7Q60809 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cnot7Q60809 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cnot7Q60809 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cnot7Q60809 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cnot7Q60809 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cnot7Q60809 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cnot7Q60809 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cnot7Q60809 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cnot7Q60809 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cnot7Q60809 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cnot7Q60809 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cnot7Q60809 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cnot7Q60809 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cnot7Q60809 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cnot7Q60809 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cnot7Q60809 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cnot7Q60809 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cnot7Q60809 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cnot7Q60809 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cnot7Q60809 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cnot7Q60809 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cnot7Q60809 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cnot7Q60809 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cnot7Q60809 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cnot7Q60809 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cnot7Q60809 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cnot7Q60809 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Cnot7Q60809 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Cnot7Q60809 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cnot7Q60809 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cnot7Q60809 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms