Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klf4Q60793 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klf4Q60793 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klf4Q60793 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Klf4Q60793 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klf4Q60793 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klf4Q60793 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klf4Q60793 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klf4Q60793 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klf4Q60793 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klf4Q60793 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klf4Q60793 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klf4Q60793 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klf4Q60793 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klf4Q60793 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klf4Q60793 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klf4Q60793 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klf4Q60793 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klf4Q60793 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klf4Q60793 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klf4Q60793 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klf4Q60793 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Klf4Q60793 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klf4Q60793 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klf4Q60793 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klf4Q60793 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klf4Q60793 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klf4Q60793 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klf4Q60793 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klf4Q60793 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klf4Q60793 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klf4Q60793 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klf4Q60793 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klf4Q60793 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klf4Q60793 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klf4Q60793 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Klf4Q60793 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klf4Q60793 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Klf4Q60793 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Klf4Q60793 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klf4Q60793 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klf4Q60793 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klf4Q60793 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klf4Q60793 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klf4Q60793 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klf4Q60793 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Klf4Q60793 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klf4Q60793 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klf4Q60793 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klf4Q60793 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klf4Q60793 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klf4Q60793 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klf4Q60793 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klf4Q60793 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klf4Q60793 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klf4Q60793 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klf4Q60793 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klf4Q60793 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klf4Q60793 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Klf4Q60793 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klf4Q60793 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klf4Q60793 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klf4Q60793 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klf4Q60793 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klf4Q60793 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klf4Q60793 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klf4Q60793 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klf4Q60793 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klf4Q60793 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klf4Q60793 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klf4Q60793 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klf4Q60793 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klf4Q60793 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klf4Q60793 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klf4Q60793 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klf4Q60793 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klf4Q60793 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klf4Q60793 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Klf4Q60793 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klf4Q60793 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klf4Q60793 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klf4Q60793 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klf4Q60793 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klf4Q60793 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klf4Q60793 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klf4Q60793 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klf4Q60793 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Klf4Q60793 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klf4Q60793 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klf4Q60793 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klf4Q60793 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klf4Q60793 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klf4Q60793 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klf4Q60793 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klf4Q60793 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klf4Q60793 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klf4Q60793 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klf4Q60793 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klf4Q60793 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klf4Q60793 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms