Protein–RNA interactions for Protein: Q60770

Stxbp3, Syntaxin-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp3Q60770 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stxbp3Q60770 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stxbp3Q60770 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stxbp3Q60770 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stxbp3Q60770 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stxbp3Q60770 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stxbp3Q60770 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stxbp3Q60770 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stxbp3Q60770 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stxbp3Q60770 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stxbp3Q60770 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Stxbp3Q60770 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stxbp3Q60770 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stxbp3Q60770 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stxbp3Q60770 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stxbp3Q60770 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stxbp3Q60770 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stxbp3Q60770 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stxbp3Q60770 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stxbp3Q60770 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stxbp3Q60770 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stxbp3Q60770 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stxbp3Q60770 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stxbp3Q60770 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stxbp3Q60770 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stxbp3Q60770 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stxbp3Q60770 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stxbp3Q60770 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stxbp3Q60770 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stxbp3Q60770 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Stxbp3Q60770 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stxbp3Q60770 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stxbp3Q60770 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Stxbp3Q60770 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stxbp3Q60770 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Stxbp3Q60770 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stxbp3Q60770 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stxbp3Q60770 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stxbp3Q60770 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stxbp3Q60770 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stxbp3Q60770 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stxbp3Q60770 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stxbp3Q60770 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stxbp3Q60770 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stxbp3Q60770 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Stxbp3Q60770 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stxbp3Q60770 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stxbp3Q60770 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stxbp3Q60770 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stxbp3Q60770 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Stxbp3Q60770 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stxbp3Q60770 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Stxbp3Q60770 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stxbp3Q60770 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stxbp3Q60770 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stxbp3Q60770 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stxbp3Q60770 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Stxbp3Q60770 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Stxbp3Q60770 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Stxbp3Q60770 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Stxbp3Q60770 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stxbp3Q60770 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stxbp3Q60770 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stxbp3Q60770 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stxbp3Q60770 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stxbp3Q60770 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stxbp3Q60770 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stxbp3Q60770 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stxbp3Q60770 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stxbp3Q60770 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stxbp3Q60770 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stxbp3Q60770 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stxbp3Q60770 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stxbp3Q60770 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stxbp3Q60770 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stxbp3Q60770 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stxbp3Q60770 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stxbp3Q60770 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stxbp3Q60770 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stxbp3Q60770 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stxbp3Q60770 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stxbp3Q60770 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stxbp3Q60770 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stxbp3Q60770 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stxbp3Q60770 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stxbp3Q60770 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stxbp3Q60770 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stxbp3Q60770 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stxbp3Q60770 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stxbp3Q60770 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stxbp3Q60770 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stxbp3Q60770 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stxbp3Q60770 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stxbp3Q60770 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stxbp3Q60770 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stxbp3Q60770 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stxbp3Q60770 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stxbp3Q60770 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stxbp3Q60770 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stxbp3Q60770 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms