Protein–RNA interactions for Protein: Q60716

P4ha2, Prolyl 4-hydroxylase subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P4ha2Q60716 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P4ha2Q60716 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P4ha2Q60716 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P4ha2Q60716 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P4ha2Q60716 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P4ha2Q60716 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P4ha2Q60716 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P4ha2Q60716 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P4ha2Q60716 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P4ha2Q60716 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P4ha2Q60716 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P4ha2Q60716 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
P4ha2Q60716 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P4ha2Q60716 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P4ha2Q60716 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P4ha2Q60716 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P4ha2Q60716 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P4ha2Q60716 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P4ha2Q60716 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P4ha2Q60716 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P4ha2Q60716 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P4ha2Q60716 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P4ha2Q60716 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
P4ha2Q60716 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P4ha2Q60716 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P4ha2Q60716 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P4ha2Q60716 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P4ha2Q60716 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P4ha2Q60716 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P4ha2Q60716 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P4ha2Q60716 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P4ha2Q60716 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P4ha2Q60716 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P4ha2Q60716 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P4ha2Q60716 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P4ha2Q60716 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P4ha2Q60716 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P4ha2Q60716 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P4ha2Q60716 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
P4ha2Q60716 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P4ha2Q60716 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P4ha2Q60716 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P4ha2Q60716 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P4ha2Q60716 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P4ha2Q60716 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P4ha2Q60716 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P4ha2Q60716 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P4ha2Q60716 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
P4ha2Q60716 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
P4ha2Q60716 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
P4ha2Q60716 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
P4ha2Q60716 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
P4ha2Q60716 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P4ha2Q60716 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P4ha2Q60716 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P4ha2Q60716 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P4ha2Q60716 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P4ha2Q60716 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P4ha2Q60716 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P4ha2Q60716 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
P4ha2Q60716 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P4ha2Q60716 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
P4ha2Q60716 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P4ha2Q60716 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
P4ha2Q60716 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P4ha2Q60716 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
P4ha2Q60716 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P4ha2Q60716 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P4ha2Q60716 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P4ha2Q60716 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
P4ha2Q60716 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P4ha2Q60716 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P4ha2Q60716 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P4ha2Q60716 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
P4ha2Q60716 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P4ha2Q60716 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P4ha2Q60716 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P4ha2Q60716 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P4ha2Q60716 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P4ha2Q60716 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P4ha2Q60716 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P4ha2Q60716 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
P4ha2Q60716 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P4ha2Q60716 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P4ha2Q60716 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
P4ha2Q60716 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P4ha2Q60716 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
P4ha2Q60716 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P4ha2Q60716 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P4ha2Q60716 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
P4ha2Q60716 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P4ha2Q60716 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P4ha2Q60716 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P4ha2Q60716 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P4ha2Q60716 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
P4ha2Q60716 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P4ha2Q60716 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P4ha2Q60716 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P4ha2Q60716 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P4ha2Q60716 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms