Protein–RNA interactions for Protein: Q60696

Pmel, Melanocyte protein PMEL, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmelQ60696 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PmelQ60696 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PmelQ60696 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PmelQ60696 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PmelQ60696 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PmelQ60696 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PmelQ60696 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PmelQ60696 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PmelQ60696 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PmelQ60696 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PmelQ60696 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PmelQ60696 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PmelQ60696 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PmelQ60696 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PmelQ60696 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PmelQ60696 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PmelQ60696 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PmelQ60696 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PmelQ60696 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PmelQ60696 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PmelQ60696 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PmelQ60696 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PmelQ60696 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PmelQ60696 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PmelQ60696 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PmelQ60696 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PmelQ60696 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PmelQ60696 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PmelQ60696 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PmelQ60696 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PmelQ60696 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PmelQ60696 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PmelQ60696 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PmelQ60696 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PmelQ60696 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PmelQ60696 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PmelQ60696 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PmelQ60696 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PmelQ60696 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PmelQ60696 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PmelQ60696 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PmelQ60696 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PmelQ60696 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PmelQ60696 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PmelQ60696 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PmelQ60696 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PmelQ60696 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PmelQ60696 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PmelQ60696 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PmelQ60696 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PmelQ60696 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PmelQ60696 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PmelQ60696 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PmelQ60696 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PmelQ60696 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PmelQ60696 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PmelQ60696 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PmelQ60696 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PmelQ60696 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PmelQ60696 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PmelQ60696 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PmelQ60696 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PmelQ60696 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PmelQ60696 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PmelQ60696 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PmelQ60696 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PmelQ60696 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PmelQ60696 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PmelQ60696 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PmelQ60696 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PmelQ60696 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PmelQ60696 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PmelQ60696 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PmelQ60696 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PmelQ60696 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PmelQ60696 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PmelQ60696 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PmelQ60696 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PmelQ60696 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PmelQ60696 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PmelQ60696 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PmelQ60696 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PmelQ60696 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PmelQ60696 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PmelQ60696 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PmelQ60696 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PmelQ60696 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PmelQ60696 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PmelQ60696 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PmelQ60696 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PmelQ60696 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PmelQ60696 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PmelQ60696 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PmelQ60696 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PmelQ60696 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PmelQ60696 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PmelQ60696 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PmelQ60696 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PmelQ60696 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PmelQ60696 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms