Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Foxd4Q60688 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Foxd4Q60688 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Foxd4Q60688 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Foxd4Q60688 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Foxd4Q60688 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Foxd4Q60688 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Foxd4Q60688 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Foxd4Q60688 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Foxd4Q60688 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Foxd4Q60688 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Foxd4Q60688 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Foxd4Q60688 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Foxd4Q60688 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Foxd4Q60688 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Foxd4Q60688 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Foxd4Q60688 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Foxd4Q60688 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Foxd4Q60688 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Foxd4Q60688 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Foxd4Q60688 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Foxd4Q60688 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Foxd4Q60688 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Foxd4Q60688 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Foxd4Q60688 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Foxd4Q60688 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Foxd4Q60688 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Foxd4Q60688 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Foxd4Q60688 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Foxd4Q60688 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Foxd4Q60688 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Foxd4Q60688 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Foxd4Q60688 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Foxd4Q60688 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Foxd4Q60688 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Foxd4Q60688 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Foxd4Q60688 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Foxd4Q60688 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Foxd4Q60688 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Foxd4Q60688 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Foxd4Q60688 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Foxd4Q60688 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Foxd4Q60688 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Foxd4Q60688 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Foxd4Q60688 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Foxd4Q60688 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Foxd4Q60688 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Foxd4Q60688 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Foxd4Q60688 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Foxd4Q60688 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Foxd4Q60688 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Foxd4Q60688 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Foxd4Q60688 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Foxd4Q60688 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Foxd4Q60688 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Foxd4Q60688 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Foxd4Q60688 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Foxd4Q60688 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Foxd4Q60688 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Foxd4Q60688 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Foxd4Q60688 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Foxd4Q60688 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Foxd4Q60688 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Foxd4Q60688 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Foxd4Q60688 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Foxd4Q60688 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Foxd4Q60688 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Foxd4Q60688 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Foxd4Q60688 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Foxd4Q60688 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Foxd4Q60688 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Foxd4Q60688 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Foxd4Q60688 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Foxd4Q60688 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Foxd4Q60688 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Foxd4Q60688 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Foxd4Q60688 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Foxd4Q60688 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Foxd4Q60688 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Foxd4Q60688 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Foxd4Q60688 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Foxd4Q60688 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Foxd4Q60688 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Foxd4Q60688 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Foxd4Q60688 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Foxd4Q60688 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Foxd4Q60688 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Foxd4Q60688 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Foxd4Q60688 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Foxd4Q60688 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Foxd4Q60688 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Foxd4Q60688 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Foxd4Q60688 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Foxd4Q60688 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Foxd4Q60688 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Foxd4Q60688 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Foxd4Q60688 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Foxd4Q60688 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Foxd4Q60688 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Foxd4Q60688 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms