Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ItgaeQ60677 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ItgaeQ60677 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ItgaeQ60677 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ItgaeQ60677 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ItgaeQ60677 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ItgaeQ60677 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ItgaeQ60677 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ItgaeQ60677 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ItgaeQ60677 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ItgaeQ60677 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ItgaeQ60677 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ItgaeQ60677 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ItgaeQ60677 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ItgaeQ60677 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ItgaeQ60677 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ItgaeQ60677 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ItgaeQ60677 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ItgaeQ60677 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ItgaeQ60677 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ItgaeQ60677 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ItgaeQ60677 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ItgaeQ60677 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ItgaeQ60677 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ItgaeQ60677 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ItgaeQ60677 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ItgaeQ60677 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ItgaeQ60677 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ItgaeQ60677 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ItgaeQ60677 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ItgaeQ60677 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ItgaeQ60677 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ItgaeQ60677 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ItgaeQ60677 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ItgaeQ60677 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ItgaeQ60677 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ItgaeQ60677 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ItgaeQ60677 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ItgaeQ60677 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ItgaeQ60677 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ItgaeQ60677 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ItgaeQ60677 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ItgaeQ60677 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ItgaeQ60677 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ItgaeQ60677 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ItgaeQ60677 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ItgaeQ60677 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ItgaeQ60677 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ItgaeQ60677 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ItgaeQ60677 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ItgaeQ60677 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ItgaeQ60677 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ItgaeQ60677 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ItgaeQ60677 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ItgaeQ60677 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ItgaeQ60677 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ItgaeQ60677 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ItgaeQ60677 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ItgaeQ60677 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ItgaeQ60677 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ItgaeQ60677 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ItgaeQ60677 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ItgaeQ60677 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ItgaeQ60677 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ItgaeQ60677 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ItgaeQ60677 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ItgaeQ60677 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ItgaeQ60677 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ItgaeQ60677 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ItgaeQ60677 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ItgaeQ60677 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ItgaeQ60677 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ItgaeQ60677 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ItgaeQ60677 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ItgaeQ60677 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ItgaeQ60677 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ItgaeQ60677 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ItgaeQ60677 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ItgaeQ60677 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ItgaeQ60677 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.33■■□□□ 1
ItgaeQ60677 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ItgaeQ60677 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ItgaeQ60677 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ItgaeQ60677 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ItgaeQ60677 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ItgaeQ60677 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ItgaeQ60677 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ItgaeQ60677 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ItgaeQ60677 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ItgaeQ60677 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ItgaeQ60677 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ItgaeQ60677 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ItgaeQ60677 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ItgaeQ60677 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ItgaeQ60677 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ItgaeQ60677 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ItgaeQ60677 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ItgaeQ60677 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ItgaeQ60677 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ItgaeQ60677 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms