Protein–RNA interactions for Protein: Q60662

Akap4, A-kinase anchor protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 849 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Akap4Q60662 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Akap4Q60662 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Akap4Q60662 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Akap4Q60662 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Akap4Q60662 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Akap4Q60662 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Akap4Q60662 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Akap4Q60662 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Akap4Q60662 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Akap4Q60662 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Akap4Q60662 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Akap4Q60662 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Akap4Q60662 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Akap4Q60662 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Akap4Q60662 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Akap4Q60662 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Akap4Q60662 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Akap4Q60662 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Akap4Q60662 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Akap4Q60662 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Akap4Q60662 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Akap4Q60662 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Akap4Q60662 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Akap4Q60662 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Akap4Q60662 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Akap4Q60662 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Akap4Q60662 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Akap4Q60662 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Akap4Q60662 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Akap4Q60662 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Akap4Q60662 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Akap4Q60662 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Akap4Q60662 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Akap4Q60662 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Akap4Q60662 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Akap4Q60662 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Akap4Q60662 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Akap4Q60662 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Akap4Q60662 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Akap4Q60662 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Akap4Q60662 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Akap4Q60662 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Akap4Q60662 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Akap4Q60662 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Akap4Q60662 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Akap4Q60662 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Akap4Q60662 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Akap4Q60662 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Akap4Q60662 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Akap4Q60662 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Akap4Q60662 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Akap4Q60662 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Akap4Q60662 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Akap4Q60662 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Akap4Q60662 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Akap4Q60662 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Akap4Q60662 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Akap4Q60662 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Akap4Q60662 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Akap4Q60662 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Akap4Q60662 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Akap4Q60662 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Akap4Q60662 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Akap4Q60662 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Akap4Q60662 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Akap4Q60662 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Akap4Q60662 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Akap4Q60662 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Akap4Q60662 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Akap4Q60662 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Akap4Q60662 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Akap4Q60662 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Akap4Q60662 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Akap4Q60662 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Akap4Q60662 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Akap4Q60662 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Akap4Q60662 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Akap4Q60662 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Akap4Q60662 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Akap4Q60662 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Akap4Q60662 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Akap4Q60662 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Akap4Q60662 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Akap4Q60662 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Akap4Q60662 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Akap4Q60662 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Akap4Q60662 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Akap4Q60662 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Akap4Q60662 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Akap4Q60662 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Akap4Q60662 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Akap4Q60662 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Akap4Q60662 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Akap4Q60662 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Akap4Q60662 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Akap4Q60662 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Akap4Q60662 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Akap4Q60662 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Akap4Q60662 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Akap4Q60662 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms