Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sin3aQ60520 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sin3aQ60520 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sin3aQ60520 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sin3aQ60520 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sin3aQ60520 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sin3aQ60520 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sin3aQ60520 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sin3aQ60520 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sin3aQ60520 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sin3aQ60520 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sin3aQ60520 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sin3aQ60520 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sin3aQ60520 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sin3aQ60520 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sin3aQ60520 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sin3aQ60520 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sin3aQ60520 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sin3aQ60520 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sin3aQ60520 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sin3aQ60520 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sin3aQ60520 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sin3aQ60520 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sin3aQ60520 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sin3aQ60520 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sin3aQ60520 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sin3aQ60520 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sin3aQ60520 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sin3aQ60520 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sin3aQ60520 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sin3aQ60520 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sin3aQ60520 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Sin3aQ60520 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Sin3aQ60520 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sin3aQ60520 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Sin3aQ60520 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sin3aQ60520 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sin3aQ60520 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sin3aQ60520 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sin3aQ60520 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sin3aQ60520 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sin3aQ60520 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sin3aQ60520 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Sin3aQ60520 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sin3aQ60520 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sin3aQ60520 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sin3aQ60520 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sin3aQ60520 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sin3aQ60520 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sin3aQ60520 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sin3aQ60520 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sin3aQ60520 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sin3aQ60520 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Sin3aQ60520 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sin3aQ60520 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sin3aQ60520 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sin3aQ60520 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sin3aQ60520 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sin3aQ60520 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sin3aQ60520 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sin3aQ60520 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sin3aQ60520 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sin3aQ60520 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sin3aQ60520 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sin3aQ60520 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sin3aQ60520 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sin3aQ60520 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sin3aQ60520 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Sin3aQ60520 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sin3aQ60520 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sin3aQ60520 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sin3aQ60520 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Sin3aQ60520 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Sin3aQ60520 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Sin3aQ60520 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Sin3aQ60520 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Sin3aQ60520 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Sin3aQ60520 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Sin3aQ60520 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sin3aQ60520 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Sin3aQ60520 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sin3aQ60520 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sin3aQ60520 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sin3aQ60520 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sin3aQ60520 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sin3aQ60520 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sin3aQ60520 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sin3aQ60520 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sin3aQ60520 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sin3aQ60520 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sin3aQ60520 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sin3aQ60520 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sin3aQ60520 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sin3aQ60520 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sin3aQ60520 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sin3aQ60520 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sin3aQ60520 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sin3aQ60520 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sin3aQ60520 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Sin3aQ60520 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms