Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C3

Scaf1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf1Q5U4C3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Scaf1Q5U4C3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Scaf1Q5U4C3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Scaf1Q5U4C3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Scaf1Q5U4C3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Scaf1Q5U4C3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Scaf1Q5U4C3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Scaf1Q5U4C3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Scaf1Q5U4C3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Scaf1Q5U4C3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Scaf1Q5U4C3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Scaf1Q5U4C3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Scaf1Q5U4C3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Scaf1Q5U4C3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Scaf1Q5U4C3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Scaf1Q5U4C3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Scaf1Q5U4C3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Scaf1Q5U4C3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Scaf1Q5U4C3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Scaf1Q5U4C3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Scaf1Q5U4C3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Scaf1Q5U4C3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Scaf1Q5U4C3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Scaf1Q5U4C3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Scaf1Q5U4C3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Scaf1Q5U4C3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Scaf1Q5U4C3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Scaf1Q5U4C3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Scaf1Q5U4C3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Scaf1Q5U4C3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Scaf1Q5U4C3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Scaf1Q5U4C3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Scaf1Q5U4C3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Scaf1Q5U4C3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Scaf1Q5U4C3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Scaf1Q5U4C3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Scaf1Q5U4C3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Scaf1Q5U4C3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Scaf1Q5U4C3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Scaf1Q5U4C3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Scaf1Q5U4C3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Scaf1Q5U4C3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Scaf1Q5U4C3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Scaf1Q5U4C3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Scaf1Q5U4C3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Scaf1Q5U4C3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Scaf1Q5U4C3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Scaf1Q5U4C3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Scaf1Q5U4C3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Scaf1Q5U4C3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Scaf1Q5U4C3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Scaf1Q5U4C3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Scaf1Q5U4C3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Scaf1Q5U4C3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Scaf1Q5U4C3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Scaf1Q5U4C3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Scaf1Q5U4C3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Scaf1Q5U4C3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Scaf1Q5U4C3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Scaf1Q5U4C3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Scaf1Q5U4C3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Scaf1Q5U4C3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Scaf1Q5U4C3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Scaf1Q5U4C3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Scaf1Q5U4C3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Scaf1Q5U4C3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Scaf1Q5U4C3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Scaf1Q5U4C3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Scaf1Q5U4C3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Scaf1Q5U4C3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Scaf1Q5U4C3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Scaf1Q5U4C3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Scaf1Q5U4C3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Scaf1Q5U4C3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Scaf1Q5U4C3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Scaf1Q5U4C3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Scaf1Q5U4C3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Scaf1Q5U4C3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Scaf1Q5U4C3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Scaf1Q5U4C3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Scaf1Q5U4C3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Scaf1Q5U4C3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Scaf1Q5U4C3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Scaf1Q5U4C3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Scaf1Q5U4C3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Scaf1Q5U4C3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Scaf1Q5U4C3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Scaf1Q5U4C3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Scaf1Q5U4C3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Scaf1Q5U4C3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Scaf1Q5U4C3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Scaf1Q5U4C3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Scaf1Q5U4C3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Scaf1Q5U4C3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Scaf1Q5U4C3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Scaf1Q5U4C3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Scaf1Q5U4C3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Scaf1Q5U4C3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Scaf1Q5U4C3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Scaf1Q5U4C3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms