Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXY1

Specc1, Cytospin-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1Q5SXY1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Specc1Q5SXY1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Specc1Q5SXY1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Specc1Q5SXY1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Specc1Q5SXY1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Specc1Q5SXY1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Specc1Q5SXY1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Specc1Q5SXY1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Specc1Q5SXY1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Specc1Q5SXY1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Specc1Q5SXY1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Specc1Q5SXY1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Specc1Q5SXY1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Specc1Q5SXY1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Specc1Q5SXY1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Specc1Q5SXY1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Specc1Q5SXY1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Specc1Q5SXY1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Specc1Q5SXY1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Specc1Q5SXY1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Specc1Q5SXY1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Specc1Q5SXY1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Specc1Q5SXY1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Specc1Q5SXY1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Specc1Q5SXY1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Specc1Q5SXY1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Specc1Q5SXY1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Specc1Q5SXY1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Specc1Q5SXY1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Specc1Q5SXY1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Specc1Q5SXY1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Specc1Q5SXY1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Specc1Q5SXY1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Specc1Q5SXY1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Specc1Q5SXY1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Specc1Q5SXY1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Specc1Q5SXY1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Specc1Q5SXY1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Specc1Q5SXY1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Specc1Q5SXY1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Specc1Q5SXY1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Specc1Q5SXY1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Specc1Q5SXY1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Specc1Q5SXY1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Specc1Q5SXY1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Specc1Q5SXY1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Specc1Q5SXY1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Specc1Q5SXY1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Specc1Q5SXY1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Specc1Q5SXY1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Specc1Q5SXY1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Specc1Q5SXY1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Specc1Q5SXY1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Specc1Q5SXY1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Specc1Q5SXY1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Specc1Q5SXY1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Specc1Q5SXY1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Specc1Q5SXY1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Specc1Q5SXY1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Specc1Q5SXY1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Specc1Q5SXY1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Specc1Q5SXY1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Specc1Q5SXY1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Specc1Q5SXY1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Specc1Q5SXY1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Specc1Q5SXY1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Specc1Q5SXY1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Specc1Q5SXY1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Specc1Q5SXY1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Specc1Q5SXY1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Specc1Q5SXY1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Specc1Q5SXY1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Specc1Q5SXY1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Specc1Q5SXY1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Specc1Q5SXY1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Specc1Q5SXY1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Specc1Q5SXY1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Specc1Q5SXY1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Specc1Q5SXY1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Specc1Q5SXY1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Specc1Q5SXY1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Specc1Q5SXY1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Specc1Q5SXY1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Specc1Q5SXY1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Specc1Q5SXY1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Specc1Q5SXY1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Specc1Q5SXY1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Specc1Q5SXY1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Specc1Q5SXY1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Specc1Q5SXY1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Specc1Q5SXY1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Specc1Q5SXY1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Specc1Q5SXY1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Specc1Q5SXY1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Specc1Q5SXY1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Specc1Q5SXY1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Specc1Q5SXY1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Specc1Q5SXY1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Specc1Q5SXY1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Specc1Q5SXY1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms