Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Brip1Q5SXJ3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Brip1Q5SXJ3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Brip1Q5SXJ3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Brip1Q5SXJ3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Brip1Q5SXJ3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Brip1Q5SXJ3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brip1Q5SXJ3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brip1Q5SXJ3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brip1Q5SXJ3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brip1Q5SXJ3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brip1Q5SXJ3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brip1Q5SXJ3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brip1Q5SXJ3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brip1Q5SXJ3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Brip1Q5SXJ3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brip1Q5SXJ3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brip1Q5SXJ3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brip1Q5SXJ3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brip1Q5SXJ3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Brip1Q5SXJ3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brip1Q5SXJ3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brip1Q5SXJ3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brip1Q5SXJ3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brip1Q5SXJ3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brip1Q5SXJ3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brip1Q5SXJ3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brip1Q5SXJ3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brip1Q5SXJ3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brip1Q5SXJ3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brip1Q5SXJ3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Brip1Q5SXJ3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brip1Q5SXJ3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brip1Q5SXJ3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Brip1Q5SXJ3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brip1Q5SXJ3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brip1Q5SXJ3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Brip1Q5SXJ3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brip1Q5SXJ3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brip1Q5SXJ3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brip1Q5SXJ3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brip1Q5SXJ3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brip1Q5SXJ3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brip1Q5SXJ3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brip1Q5SXJ3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brip1Q5SXJ3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brip1Q5SXJ3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brip1Q5SXJ3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brip1Q5SXJ3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brip1Q5SXJ3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brip1Q5SXJ3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brip1Q5SXJ3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Brip1Q5SXJ3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Brip1Q5SXJ3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Brip1Q5SXJ3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brip1Q5SXJ3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brip1Q5SXJ3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Brip1Q5SXJ3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brip1Q5SXJ3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brip1Q5SXJ3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brip1Q5SXJ3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brip1Q5SXJ3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brip1Q5SXJ3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brip1Q5SXJ3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brip1Q5SXJ3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brip1Q5SXJ3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brip1Q5SXJ3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brip1Q5SXJ3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brip1Q5SXJ3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brip1Q5SXJ3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brip1Q5SXJ3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brip1Q5SXJ3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brip1Q5SXJ3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brip1Q5SXJ3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brip1Q5SXJ3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brip1Q5SXJ3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brip1Q5SXJ3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Brip1Q5SXJ3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brip1Q5SXJ3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brip1Q5SXJ3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brip1Q5SXJ3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brip1Q5SXJ3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brip1Q5SXJ3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brip1Q5SXJ3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brip1Q5SXJ3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brip1Q5SXJ3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brip1Q5SXJ3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brip1Q5SXJ3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brip1Q5SXJ3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brip1Q5SXJ3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brip1Q5SXJ3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brip1Q5SXJ3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brip1Q5SXJ3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brip1Q5SXJ3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brip1Q5SXJ3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brip1Q5SXJ3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brip1Q5SXJ3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brip1Q5SXJ3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brip1Q5SXJ3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brip1Q5SXJ3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms