Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWP3

Nacad, NAC-alpha domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NacadQ5SWP3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC37.25■■■■□ 3.55
NacadQ5SWP3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
NacadQ5SWP3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
NacadQ5SWP3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
NacadQ5SWP3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
NacadQ5SWP3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
NacadQ5SWP3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
NacadQ5SWP3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
NacadQ5SWP3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
NacadQ5SWP3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
NacadQ5SWP3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
NacadQ5SWP3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
NacadQ5SWP3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
NacadQ5SWP3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC37.23■■■■□ 3.55
NacadQ5SWP3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
NacadQ5SWP3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
NacadQ5SWP3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
NacadQ5SWP3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
NacadQ5SWP3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
NacadQ5SWP3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
NacadQ5SWP3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
NacadQ5SWP3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
NacadQ5SWP3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC37.21■■■■□ 3.55
NacadQ5SWP3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
NacadQ5SWP3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
NacadQ5SWP3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.55
NacadQ5SWP3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
NacadQ5SWP3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.55
NacadQ5SWP3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
NacadQ5SWP3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.55
NacadQ5SWP3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
NacadQ5SWP3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
NacadQ5SWP3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
NacadQ5SWP3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
NacadQ5SWP3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
NacadQ5SWP3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
NacadQ5SWP3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
NacadQ5SWP3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
NacadQ5SWP3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
NacadQ5SWP3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
NacadQ5SWP3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
NacadQ5SWP3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
NacadQ5SWP3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
NacadQ5SWP3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
NacadQ5SWP3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
NacadQ5SWP3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
NacadQ5SWP3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
NacadQ5SWP3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
NacadQ5SWP3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
NacadQ5SWP3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
NacadQ5SWP3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
NacadQ5SWP3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
NacadQ5SWP3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
NacadQ5SWP3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
NacadQ5SWP3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
NacadQ5SWP3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
NacadQ5SWP3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
NacadQ5SWP3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
NacadQ5SWP3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
NacadQ5SWP3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
NacadQ5SWP3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
NacadQ5SWP3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.15■■■■□ 3.54
NacadQ5SWP3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
NacadQ5SWP3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
NacadQ5SWP3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC37.15■■■■□ 3.54
NacadQ5SWP3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
NacadQ5SWP3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
NacadQ5SWP3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
NacadQ5SWP3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
NacadQ5SWP3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
NacadQ5SWP3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
NacadQ5SWP3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC37.13■■■■□ 3.53
NacadQ5SWP3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
NacadQ5SWP3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
NacadQ5SWP3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
NacadQ5SWP3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
NacadQ5SWP3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
NacadQ5SWP3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
NacadQ5SWP3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
NacadQ5SWP3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
NacadQ5SWP3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
NacadQ5SWP3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
NacadQ5SWP3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
NacadQ5SWP3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
NacadQ5SWP3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC37.11■■■■□ 3.53
NacadQ5SWP3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC37.1■■■■□ 3.53
NacadQ5SWP3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
NacadQ5SWP3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC37.1■■■■□ 3.53
NacadQ5SWP3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
NacadQ5SWP3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
NacadQ5SWP3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
NacadQ5SWP3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC37.09■■■■□ 3.53
NacadQ5SWP3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
NacadQ5SWP3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
NacadQ5SWP3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
NacadQ5SWP3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
NacadQ5SWP3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
NacadQ5SWP3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
NacadQ5SWP3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
NacadQ5SWP3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms