Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUR0

Pfas, Phosphoribosylformylglycinamidine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PfasQ5SUR0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PfasQ5SUR0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PfasQ5SUR0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PfasQ5SUR0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PfasQ5SUR0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PfasQ5SUR0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PfasQ5SUR0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PfasQ5SUR0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PfasQ5SUR0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PfasQ5SUR0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PfasQ5SUR0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PfasQ5SUR0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PfasQ5SUR0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PfasQ5SUR0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PfasQ5SUR0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PfasQ5SUR0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PfasQ5SUR0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PfasQ5SUR0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PfasQ5SUR0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PfasQ5SUR0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PfasQ5SUR0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PfasQ5SUR0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PfasQ5SUR0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PfasQ5SUR0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PfasQ5SUR0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PfasQ5SUR0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PfasQ5SUR0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PfasQ5SUR0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PfasQ5SUR0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PfasQ5SUR0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PfasQ5SUR0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PfasQ5SUR0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PfasQ5SUR0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PfasQ5SUR0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PfasQ5SUR0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PfasQ5SUR0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PfasQ5SUR0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PfasQ5SUR0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PfasQ5SUR0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PfasQ5SUR0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PfasQ5SUR0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PfasQ5SUR0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PfasQ5SUR0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PfasQ5SUR0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PfasQ5SUR0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PfasQ5SUR0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PfasQ5SUR0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PfasQ5SUR0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PfasQ5SUR0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PfasQ5SUR0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PfasQ5SUR0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PfasQ5SUR0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PfasQ5SUR0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PfasQ5SUR0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PfasQ5SUR0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PfasQ5SUR0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PfasQ5SUR0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PfasQ5SUR0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PfasQ5SUR0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PfasQ5SUR0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PfasQ5SUR0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PfasQ5SUR0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PfasQ5SUR0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PfasQ5SUR0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PfasQ5SUR0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PfasQ5SUR0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PfasQ5SUR0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PfasQ5SUR0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PfasQ5SUR0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PfasQ5SUR0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PfasQ5SUR0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PfasQ5SUR0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PfasQ5SUR0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PfasQ5SUR0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PfasQ5SUR0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PfasQ5SUR0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PfasQ5SUR0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PfasQ5SUR0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PfasQ5SUR0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PfasQ5SUR0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PfasQ5SUR0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PfasQ5SUR0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PfasQ5SUR0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PfasQ5SUR0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PfasQ5SUR0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PfasQ5SUR0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PfasQ5SUR0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PfasQ5SUR0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PfasQ5SUR0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PfasQ5SUR0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PfasQ5SUR0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PfasQ5SUR0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PfasQ5SUR0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PfasQ5SUR0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PfasQ5SUR0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PfasQ5SUR0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PfasQ5SUR0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PfasQ5SUR0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PfasQ5SUR0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PfasQ5SUR0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms