Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ7

Znrf3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znrf3Q5SSZ7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Znrf3Q5SSZ7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Znrf3Q5SSZ7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znrf3Q5SSZ7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znrf3Q5SSZ7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znrf3Q5SSZ7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znrf3Q5SSZ7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znrf3Q5SSZ7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znrf3Q5SSZ7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znrf3Q5SSZ7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Znrf3Q5SSZ7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Znrf3Q5SSZ7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znrf3Q5SSZ7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Znrf3Q5SSZ7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Znrf3Q5SSZ7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Znrf3Q5SSZ7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Znrf3Q5SSZ7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Znrf3Q5SSZ7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Znrf3Q5SSZ7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Znrf3Q5SSZ7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Znrf3Q5SSZ7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Znrf3Q5SSZ7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Znrf3Q5SSZ7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Znrf3Q5SSZ7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Znrf3Q5SSZ7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Znrf3Q5SSZ7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Znrf3Q5SSZ7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Znrf3Q5SSZ7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Znrf3Q5SSZ7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Znrf3Q5SSZ7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Znrf3Q5SSZ7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Znrf3Q5SSZ7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Znrf3Q5SSZ7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Znrf3Q5SSZ7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Znrf3Q5SSZ7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Znrf3Q5SSZ7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Znrf3Q5SSZ7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Znrf3Q5SSZ7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Znrf3Q5SSZ7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Znrf3Q5SSZ7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Znrf3Q5SSZ7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Znrf3Q5SSZ7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Znrf3Q5SSZ7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Znrf3Q5SSZ7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Znrf3Q5SSZ7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Znrf3Q5SSZ7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Znrf3Q5SSZ7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Znrf3Q5SSZ7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Znrf3Q5SSZ7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Znrf3Q5SSZ7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znrf3Q5SSZ7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Znrf3Q5SSZ7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znrf3Q5SSZ7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znrf3Q5SSZ7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znrf3Q5SSZ7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znrf3Q5SSZ7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Znrf3Q5SSZ7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Znrf3Q5SSZ7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Znrf3Q5SSZ7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Znrf3Q5SSZ7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Znrf3Q5SSZ7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Znrf3Q5SSZ7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Znrf3Q5SSZ7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Znrf3Q5SSZ7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Znrf3Q5SSZ7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Znrf3Q5SSZ7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Znrf3Q5SSZ7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Znrf3Q5SSZ7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znrf3Q5SSZ7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znrf3Q5SSZ7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znrf3Q5SSZ7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znrf3Q5SSZ7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znrf3Q5SSZ7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znrf3Q5SSZ7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znrf3Q5SSZ7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znrf3Q5SSZ7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znrf3Q5SSZ7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znrf3Q5SSZ7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znrf3Q5SSZ7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Znrf3Q5SSZ7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znrf3Q5SSZ7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znrf3Q5SSZ7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znrf3Q5SSZ7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znrf3Q5SSZ7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znrf3Q5SSZ7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znrf3Q5SSZ7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znrf3Q5SSZ7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znrf3Q5SSZ7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znrf3Q5SSZ7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Znrf3Q5SSZ7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Znrf3Q5SSZ7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Znrf3Q5SSZ7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Znrf3Q5SSZ7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Znrf3Q5SSZ7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Znrf3Q5SSZ7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znrf3Q5SSZ7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znrf3Q5SSZ7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znrf3Q5SSZ7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znrf3Q5SSZ7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znrf3Q5SSZ7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.2 ms