Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQF8

Sap30l, Histone deacetylase complex subunit SAP30L, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap30lQ5SQF8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sap30lQ5SQF8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sap30lQ5SQF8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sap30lQ5SQF8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sap30lQ5SQF8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sap30lQ5SQF8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sap30lQ5SQF8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sap30lQ5SQF8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sap30lQ5SQF8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sap30lQ5SQF8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sap30lQ5SQF8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sap30lQ5SQF8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sap30lQ5SQF8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sap30lQ5SQF8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sap30lQ5SQF8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sap30lQ5SQF8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sap30lQ5SQF8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sap30lQ5SQF8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sap30lQ5SQF8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sap30lQ5SQF8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sap30lQ5SQF8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sap30lQ5SQF8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sap30lQ5SQF8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sap30lQ5SQF8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sap30lQ5SQF8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sap30lQ5SQF8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sap30lQ5SQF8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sap30lQ5SQF8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sap30lQ5SQF8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sap30lQ5SQF8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sap30lQ5SQF8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sap30lQ5SQF8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sap30lQ5SQF8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sap30lQ5SQF8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sap30lQ5SQF8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sap30lQ5SQF8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sap30lQ5SQF8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sap30lQ5SQF8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sap30lQ5SQF8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sap30lQ5SQF8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sap30lQ5SQF8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sap30lQ5SQF8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sap30lQ5SQF8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sap30lQ5SQF8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sap30lQ5SQF8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sap30lQ5SQF8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sap30lQ5SQF8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sap30lQ5SQF8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sap30lQ5SQF8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sap30lQ5SQF8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sap30lQ5SQF8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sap30lQ5SQF8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sap30lQ5SQF8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sap30lQ5SQF8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sap30lQ5SQF8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sap30lQ5SQF8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sap30lQ5SQF8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sap30lQ5SQF8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sap30lQ5SQF8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sap30lQ5SQF8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sap30lQ5SQF8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sap30lQ5SQF8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sap30lQ5SQF8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sap30lQ5SQF8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sap30lQ5SQF8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sap30lQ5SQF8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sap30lQ5SQF8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sap30lQ5SQF8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sap30lQ5SQF8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sap30lQ5SQF8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sap30lQ5SQF8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sap30lQ5SQF8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sap30lQ5SQF8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sap30lQ5SQF8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sap30lQ5SQF8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sap30lQ5SQF8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sap30lQ5SQF8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sap30lQ5SQF8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sap30lQ5SQF8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sap30lQ5SQF8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sap30lQ5SQF8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sap30lQ5SQF8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sap30lQ5SQF8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sap30lQ5SQF8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sap30lQ5SQF8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sap30lQ5SQF8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sap30lQ5SQF8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sap30lQ5SQF8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sap30lQ5SQF8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sap30lQ5SQF8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sap30lQ5SQF8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sap30lQ5SQF8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sap30lQ5SQF8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sap30lQ5SQF8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sap30lQ5SQF8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sap30lQ5SQF8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sap30lQ5SQF8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sap30lQ5SQF8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sap30lQ5SQF8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sap30lQ5SQF8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms