Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trdv4Q5R1A3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trdv4Q5R1A3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trdv4Q5R1A3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trdv4Q5R1A3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trdv4Q5R1A3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trdv4Q5R1A3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trdv4Q5R1A3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trdv4Q5R1A3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trdv4Q5R1A3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trdv4Q5R1A3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trdv4Q5R1A3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trdv4Q5R1A3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trdv4Q5R1A3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trdv4Q5R1A3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trdv4Q5R1A3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trdv4Q5R1A3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trdv4Q5R1A3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trdv4Q5R1A3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trdv4Q5R1A3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trdv4Q5R1A3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trdv4Q5R1A3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trdv4Q5R1A3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trdv4Q5R1A3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trdv4Q5R1A3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trdv4Q5R1A3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trdv4Q5R1A3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trdv4Q5R1A3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trdv4Q5R1A3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trdv4Q5R1A3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trdv4Q5R1A3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trdv4Q5R1A3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trdv4Q5R1A3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trdv4Q5R1A3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trdv4Q5R1A3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trdv4Q5R1A3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trdv4Q5R1A3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trdv4Q5R1A3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trdv4Q5R1A3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trdv4Q5R1A3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trdv4Q5R1A3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trdv4Q5R1A3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trdv4Q5R1A3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trdv4Q5R1A3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trdv4Q5R1A3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trdv4Q5R1A3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trdv4Q5R1A3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trdv4Q5R1A3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trdv4Q5R1A3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trdv4Q5R1A3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trdv4Q5R1A3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trdv4Q5R1A3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trdv4Q5R1A3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trdv4Q5R1A3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trdv4Q5R1A3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trdv4Q5R1A3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trdv4Q5R1A3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trdv4Q5R1A3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trdv4Q5R1A3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trdv4Q5R1A3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trdv4Q5R1A3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trdv4Q5R1A3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trdv4Q5R1A3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trdv4Q5R1A3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trdv4Q5R1A3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trdv4Q5R1A3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trdv4Q5R1A3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trdv4Q5R1A3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trdv4Q5R1A3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trdv4Q5R1A3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trdv4Q5R1A3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trdv4Q5R1A3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trdv4Q5R1A3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trdv4Q5R1A3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trdv4Q5R1A3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trdv4Q5R1A3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trdv4Q5R1A3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trdv4Q5R1A3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trdv4Q5R1A3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trdv4Q5R1A3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trdv4Q5R1A3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trdv4Q5R1A3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trdv4Q5R1A3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trdv4Q5R1A3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trdv4Q5R1A3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trdv4Q5R1A3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trdv4Q5R1A3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trdv4Q5R1A3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trdv4Q5R1A3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trdv4Q5R1A3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trdv4Q5R1A3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trdv4Q5R1A3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trdv4Q5R1A3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trdv4Q5R1A3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trdv4Q5R1A3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trdv4Q5R1A3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trdv4Q5R1A3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trdv4Q5R1A3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trdv4Q5R1A3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trdv4Q5R1A3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms