Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCJ1

Rapgef6, Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef6Q5NCJ1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rapgef6Q5NCJ1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rapgef6Q5NCJ1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rapgef6Q5NCJ1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rapgef6Q5NCJ1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rapgef6Q5NCJ1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Rapgef6Q5NCJ1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rapgef6Q5NCJ1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rapgef6Q5NCJ1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rapgef6Q5NCJ1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Rapgef6Q5NCJ1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Rapgef6Q5NCJ1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Rapgef6Q5NCJ1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
Rapgef6Q5NCJ1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Rapgef6Q5NCJ1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
Rapgef6Q5NCJ1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
Rapgef6Q5NCJ1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Rapgef6Q5NCJ1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Rapgef6Q5NCJ1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Rapgef6Q5NCJ1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Rapgef6Q5NCJ1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Rapgef6Q5NCJ1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Rapgef6Q5NCJ1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rapgef6Q5NCJ1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rapgef6Q5NCJ1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rapgef6Q5NCJ1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rapgef6Q5NCJ1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rapgef6Q5NCJ1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rapgef6Q5NCJ1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rapgef6Q5NCJ1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rapgef6Q5NCJ1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Rapgef6Q5NCJ1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Rapgef6Q5NCJ1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Rapgef6Q5NCJ1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Rapgef6Q5NCJ1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rapgef6Q5NCJ1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rapgef6Q5NCJ1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rapgef6Q5NCJ1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rapgef6Q5NCJ1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rapgef6Q5NCJ1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rapgef6Q5NCJ1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rapgef6Q5NCJ1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Rapgef6Q5NCJ1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Rapgef6Q5NCJ1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Rapgef6Q5NCJ1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Rapgef6Q5NCJ1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Rapgef6Q5NCJ1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Rapgef6Q5NCJ1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Rapgef6Q5NCJ1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Rapgef6Q5NCJ1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Rapgef6Q5NCJ1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Rapgef6Q5NCJ1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Rapgef6Q5NCJ1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Rapgef6Q5NCJ1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Rapgef6Q5NCJ1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rapgef6Q5NCJ1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rapgef6Q5NCJ1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rapgef6Q5NCJ1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rapgef6Q5NCJ1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rapgef6Q5NCJ1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rapgef6Q5NCJ1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rapgef6Q5NCJ1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rapgef6Q5NCJ1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rapgef6Q5NCJ1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rapgef6Q5NCJ1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Rapgef6Q5NCJ1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rapgef6Q5NCJ1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rapgef6Q5NCJ1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rapgef6Q5NCJ1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Rapgef6Q5NCJ1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rapgef6Q5NCJ1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Rapgef6Q5NCJ1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rapgef6Q5NCJ1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rapgef6Q5NCJ1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Rapgef6Q5NCJ1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rapgef6Q5NCJ1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rapgef6Q5NCJ1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rapgef6Q5NCJ1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rapgef6Q5NCJ1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rapgef6Q5NCJ1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rapgef6Q5NCJ1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rapgef6Q5NCJ1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Rapgef6Q5NCJ1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Rapgef6Q5NCJ1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Rapgef6Q5NCJ1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Rapgef6Q5NCJ1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Rapgef6Q5NCJ1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Rapgef6Q5NCJ1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Rapgef6Q5NCJ1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Rapgef6Q5NCJ1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Rapgef6Q5NCJ1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Rapgef6Q5NCJ1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Rapgef6Q5NCJ1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Rapgef6Q5NCJ1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Rapgef6Q5NCJ1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Rapgef6Q5NCJ1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Rapgef6Q5NCJ1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Rapgef6Q5NCJ1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Rapgef6Q5NCJ1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Rapgef6Q5NCJ1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms