Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim58Q5NCC9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim58Q5NCC9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim58Q5NCC9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim58Q5NCC9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim58Q5NCC9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim58Q5NCC9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim58Q5NCC9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim58Q5NCC9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim58Q5NCC9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim58Q5NCC9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim58Q5NCC9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim58Q5NCC9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim58Q5NCC9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim58Q5NCC9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim58Q5NCC9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim58Q5NCC9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim58Q5NCC9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim58Q5NCC9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim58Q5NCC9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim58Q5NCC9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim58Q5NCC9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim58Q5NCC9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim58Q5NCC9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim58Q5NCC9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim58Q5NCC9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim58Q5NCC9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim58Q5NCC9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim58Q5NCC9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim58Q5NCC9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim58Q5NCC9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim58Q5NCC9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim58Q5NCC9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim58Q5NCC9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim58Q5NCC9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim58Q5NCC9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim58Q5NCC9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim58Q5NCC9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim58Q5NCC9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim58Q5NCC9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim58Q5NCC9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim58Q5NCC9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim58Q5NCC9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim58Q5NCC9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim58Q5NCC9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim58Q5NCC9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim58Q5NCC9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim58Q5NCC9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim58Q5NCC9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim58Q5NCC9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim58Q5NCC9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim58Q5NCC9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim58Q5NCC9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim58Q5NCC9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim58Q5NCC9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim58Q5NCC9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim58Q5NCC9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Trim58Q5NCC9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Trim58Q5NCC9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Trim58Q5NCC9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Trim58Q5NCC9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim58Q5NCC9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim58Q5NCC9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim58Q5NCC9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim58Q5NCC9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim58Q5NCC9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim58Q5NCC9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim58Q5NCC9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim58Q5NCC9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim58Q5NCC9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim58Q5NCC9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim58Q5NCC9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim58Q5NCC9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim58Q5NCC9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim58Q5NCC9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim58Q5NCC9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim58Q5NCC9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim58Q5NCC9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim58Q5NCC9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim58Q5NCC9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim58Q5NCC9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim58Q5NCC9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim58Q5NCC9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim58Q5NCC9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim58Q5NCC9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim58Q5NCC9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim58Q5NCC9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim58Q5NCC9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim58Q5NCC9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim58Q5NCC9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim58Q5NCC9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim58Q5NCC9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim58Q5NCC9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim58Q5NCC9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim58Q5NCC9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim58Q5NCC9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim58Q5NCC9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim58Q5NCC9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim58Q5NCC9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim58Q5NCC9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms