Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ttf2Q5NC05 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ttf2Q5NC05 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ttf2Q5NC05 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ttf2Q5NC05 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ttf2Q5NC05 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ttf2Q5NC05 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ttf2Q5NC05 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ttf2Q5NC05 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ttf2Q5NC05 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ttf2Q5NC05 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ttf2Q5NC05 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ttf2Q5NC05 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ttf2Q5NC05 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ttf2Q5NC05 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ttf2Q5NC05 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ttf2Q5NC05 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ttf2Q5NC05 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ttf2Q5NC05 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Ttf2Q5NC05 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Ttf2Q5NC05 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Ttf2Q5NC05 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ttf2Q5NC05 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ttf2Q5NC05 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ttf2Q5NC05 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ttf2Q5NC05 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ttf2Q5NC05 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ttf2Q5NC05 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ttf2Q5NC05 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ttf2Q5NC05 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ttf2Q5NC05 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ttf2Q5NC05 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ttf2Q5NC05 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ttf2Q5NC05 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ttf2Q5NC05 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ttf2Q5NC05 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ttf2Q5NC05 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ttf2Q5NC05 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ttf2Q5NC05 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttf2Q5NC05 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttf2Q5NC05 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttf2Q5NC05 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttf2Q5NC05 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttf2Q5NC05 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttf2Q5NC05 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttf2Q5NC05 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttf2Q5NC05 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttf2Q5NC05 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttf2Q5NC05 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttf2Q5NC05 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttf2Q5NC05 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttf2Q5NC05 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttf2Q5NC05 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttf2Q5NC05 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ttf2Q5NC05 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ttf2Q5NC05 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ttf2Q5NC05 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ttf2Q5NC05 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Ttf2Q5NC05 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ttf2Q5NC05 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ttf2Q5NC05 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ttf2Q5NC05 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ttf2Q5NC05 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ttf2Q5NC05 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ttf2Q5NC05 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ttf2Q5NC05 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ttf2Q5NC05 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ttf2Q5NC05 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ttf2Q5NC05 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ttf2Q5NC05 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttf2Q5NC05 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttf2Q5NC05 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttf2Q5NC05 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttf2Q5NC05 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttf2Q5NC05 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttf2Q5NC05 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttf2Q5NC05 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttf2Q5NC05 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttf2Q5NC05 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttf2Q5NC05 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttf2Q5NC05 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttf2Q5NC05 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttf2Q5NC05 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttf2Q5NC05 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttf2Q5NC05 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttf2Q5NC05 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttf2Q5NC05 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttf2Q5NC05 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttf2Q5NC05 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttf2Q5NC05 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttf2Q5NC05 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttf2Q5NC05 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttf2Q5NC05 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttf2Q5NC05 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttf2Q5NC05 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttf2Q5NC05 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttf2Q5NC05 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttf2Q5NC05 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttf2Q5NC05 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttf2Q5NC05 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms